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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002671`

染色体: Chr06 坐标: 38614350-38619564 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002671`
名称	SmilChr06G002671
描述	protein farnesyltransferase subunit beta
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	38614350 - 38619564 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989402`
GeneID	`130989402`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989402`
原始查询	`SmilChr06G002671`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein farnesyltransferase subunit beta
产物	protein farnesyltransferase subunit beta
Arabidopsis	`AT5G40280` (ERA1) Prenyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834026] identity=56.2; qcov=0.985; evalue=9.62e-170; confidence=high
Rice	`Os01g0737800` - identity=57.6; qcov=0.98; evalue=6.94e-179; confidence=high
GO	GO:0004660 (protein farnesyltransferase activity); GO:0005965 (protein farnesyltransferase complex); GO:0018343 (protein farnesylation)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00432 (Prenyltrans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989402

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769368.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057769368.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769368.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769368.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769368.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:38614569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C55
`Chr6:38614657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B65,C49,C80,D11
`Chr6:38615124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C49
`Chr6:38615406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr6:38615412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr6:38616192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B74,D7
`Chr6:38616619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B65,C49,C80
`Chr6:38617181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:38617200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B140
`Chr6:38617203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C46
`Chr6:38617534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C55
`Chr6:38617684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769368.1

452 aa

226

452

Prenyltrans

PF00432 Prenyltrans 44-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769368.1`	Pfam	`PF00432`	Prenyltrans	Repeat	44	437	8.2e-106	354.6	Prenyltransferase alpha-alpha toroid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913385.1
TGATCATATTAATAGCGTTCAGGAAAAAGCGCTAAACCTTCCGGGTCGTGCTAAAGCCAAAATCGAACACTTGCAGCAGTCGGAGCAGCAAAGCCGCCGCAGAGCACCGTGGCCACCGGCGGCGATGGCGAGGGAGAATATGACGGGAACCAAATCGCAGGAAGATCAATGGATGGTACAGAATCAATGTTTCCGAATTTACGACATTGTCTATCGCCTTCCTCCCCATGCTCAATCCGTAAACTTCGAGGTTCGGCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989402
ATGGCGAGGGAGAATATGACGGGAACCAAATCGCAGGAAGATCAATGGATGGTACAGAATCAATGTTTCCGAATTTACGACATTGTCTATCGCCTTCCTCCCCATGCTCAATCCGTAAACTTCGAGGTTCGGCGCGAGAATCATATCGAGTATCTTACCAAAAGTCTGAAGCAGCTCGGCCCTAACTTTTATGTTTTGGATGCCAATCGACCCTGGCTTTGCTATTGGATCATACAATCGATTGCTTTGTTGGGGGATTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769368.1
MARENMTGTKSQEDQWMVQNQCFRIYDIVYRLPPHAQSVNFEVRRENHIEYLTKSLKQLGPNFYVLDANRPWLCYWIIQSIALLGDCIDDELENGFIDFLSRCQDRDGGYGGGPGQMPHLATTYAAVNALITVGGQKSLSSINREKLYAFLLRMKDASGGFRMHDGGEVDVRACYTAISVASVLNILDDRLIQNVGDYIVSCQTYEGGIAGEPGSEAHGGYAFCGLAAMVLINEADRLDLPGLLNWVVFRQGIEGGFQGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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