当前解析结果
SmilChr06G002673| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002673 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002673 |
| 描述 | protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, mitochondrial-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 38652481 - 38655857 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130989455 |
|---|---|
| GeneID | 130989455 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989455 |
| 原始查询 | SmilChr06G002673 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, mitochondrial-like |
| 产物 | protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6%2C mitochondrial-like |
| Arabidopsis | AT1G55205 (AT1G55205)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007805] identity=54.4; qcov=0.442; evalue=5.72e-09; confidence=low |
| Rice | Os01g0738000- identity=66.7; qcov=0.635; evalue=6.44e-17; confidence=low |
| GO | GO:0005739 (mitochondrion) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989455 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057769453.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057769453.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057769453.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057769453.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057769453.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:38654395 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A15,A23,C82 |
Chr6:38654398 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr6:38654584 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B128 |
Chr6:38654584 |
G |
GT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B128 |
Chr6:38654621 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B114,B21,B35,C5,D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。