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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002675`

染色体: Chr06 坐标: 38661801-38666834 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002675`
名称	SmilChr06G002675
描述	uncharacterized SmilChr06G002675
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	38661801 - 38666834 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989400`
GeneID	`130989400`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989400`
原始查询	`SmilChr06G002675`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HD domain-containing metal-dependent phosphohydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834025]; symbol=AT5G40270; hit=AT5G40270; species=arabidopsis; confidence=high
产物	HD domain-containing metal-dependent phosphohydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834025]; symbol=AT5G40270; hit=AT5G40270; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G40270` (AT5G40270) HD domain-containing metal-dependent phosphohydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834025] identity=70.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0109300` - identity=71.8; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006203 (dGTP catabolic process); GO:0008832 (dGTPase activity)
KEGG	smil03250 (Viral life cycle - HIV-1 - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01966 (HD); PF19276 (HD_assoc_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989400

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769364.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057769364.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769364.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057769365.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057769364.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:38662156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D7
`Chr6:38665142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:38665882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr6:38665904`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B118,B67,C63
`Chr6:38665904`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B118,B67,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769364.1

471 aa

236

471

HD_assoc_2

PF01966 HD 75-167 aa PF19276 HD_assoc_2 228-351 aa

XP_057769365.1

409 aa

204

409

HD_assoc_2

PF01966 HD 13-105 aa PF19276 HD_assoc_2 166-290 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769364.1`	Pfam	`PF01966`	HD	Family	75	167	1.5e-12	48.6	HD domain
`XP_057769364.1`	Pfam	`PF19276`	HD_assoc_2	Family	228	351	6.9e-06	26.4	HD associated region
`XP_057769365.1`	Pfam	`PF01966`	HD	Family	13	105	1.2e-12	48.9	HD domain
`XP_057769365.1`	Pfam	`PF19276`	HD_assoc_2	Family	166	290	5.1e-06	26.8	HD associated region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913381.1
CATTAATCGCGTAACGTTACAAAAGTGGAAAAAGCCTTTAGCTGCAGCCACACTCTTTTGGCGGCACTATTTCTCCCACTTTTCCTTTCCCAATATTCCTGCAAAACTCCGCGCAAGCAGCCGCAAAATCCTCGCCGCCACCTCCTCGCTCGACCGTACAACGCGTTTGGCACCGGGCGAGCAGCTCGGAAAAGCGAGGATGGGTGCGATTTGCGAAGACGAGTCCTCGTTATCTTCGAATCACAGTTTCGCGTGCTTGC...

XM_057913382.1
CGAGTCCTCGTTATCTTCGAATCACAGTTTCGCGTGCTTGCAGGATCTGAGATTCTCCAAGCAAGTTCATGACAATGTCCATGGAAACATTTATCTCGATCAGCTCTGTTTGAAATTTGTGGATACCGAGCAGTATCAGAGGAATGGCACACATGGTTTATCCAGGAGCTGTCCATTCTAGATTTGAACATTCTCTTGGAGTTTATTGGCTTGCTGGTGAAGCTGTTCACAAACTTAAGGCTCAGCAAGGATTAGAGCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989400
ATGGGTGCGATTTGCGAAGACGAGTCCTCGTTATCTTCGAATCACAGTTTCGCGTGCTTGCAGGATCTGAGATTCTCCAAGCAAGTTCATGACAATGTCCATGGAAACATTTATCTCGATCAGCTCTGTTTGAAATTTGTGGATACCGAGCAGTATCAGAGGCTGCGTGATCTTAAGCAACTAGGAATGGCACACATGGTTTATCCAGGAGCTGTCCATTCTAGATTTGAACATTCTCTTGGAGTTTATTGGCTTGCTGG...

LOC130989400
ATGGCACACATGGTTTATCCAGGAGCTGTCCATTCTAGATTTGAACATTCTCTTGGAGTTTATTGGCTTGCTGGTGAAGCTGTTCACAAACTTAAGGCTCAGCAAGGATTAGAGCTGGGTATTGATCGCTTTGATATGCAGACTGTGAAACTTGCAGGGCTCTTGCATGACGTAGGTCATGGACCTTTTAGTCATTTGTTTGAACGTGAGTTTCTTCCCAAGGTCGTTTTGGGATCAGAATGGTCTCATGAGCATATGTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769364.1
MGAICEDESSLSSNHSFACLQDLRFSKQVHDNVHGNIYLDQLCLKFVDTEQYQRLRDLKQLGMAHMVYPGAVHSRFEHSLGVYWLAGEAVHKLKAQQGLELGIDRFDMQTVKLAGLLHDVGHGPFSHLFEREFLPKVVLGSEWSHEHMSVEMVDHIVDEHHIDIDADTIKTVKEMILASSKYATVKSTKEKHFLYDIVANGRNGIDVDKFDYIVRDSRACALGCNFQFERLMVSMRVMEDEICYRAKEYLTIHKLFATRA...

XP_057769365.1
MAHMVYPGAVHSRFEHSLGVYWLAGEAVHKLKAQQGLELGIDRFDMQTVKLAGLLHDVGHGPFSHLFEREFLPKVVLGSEWSHEHMSVEMVDHIVDEHHIDIDADTIKTVKEMILASSKYATVKSTKEKHFLYDIVANGRNGIDVDKFDYIVRDSRACALGCNFQFERLMVSMRVMEDEICYRAKEYLTIHKLFATRADLYRTVYTHAKVKAVELMVVDALVSANSYLQIASHIQDPSQYWKLDDTIIKTIETAPDQELK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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