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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002684`

染色体: Chr06 坐标: 38785017-38785849 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002684`
名称	SmilChr06G002684
描述	uncharacterized SmilChr06G002684
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	38785017 - 38785849 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990888`
GeneID	`130990888`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990888`
原始查询	`SmilChr06G002684`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=56.1; qcov=0.66; evalue=5.76e-37; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=44.4; qcov=0.988; evalue=6.87e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990888

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771098.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771098.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771098.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771098.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771098.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:38785394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B73,C71,D3
`Chr6:38785402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B18,B80,B93
`Chr6:38785404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr6:38785405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C8
`Chr6:38785411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B80,B93
`Chr6:38785418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B36
`Chr6:38785419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B51,C24,C8
`Chr6:38785421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C60
`Chr6:38785425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:38785434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B67,C63
`Chr6:38785440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr6:38785441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C8,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771098.1

162 aa

162

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 4-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771098.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	4	104	7.3e-41	140.8	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915115.1
ATGGGGGTGCCGGTCACATATCAAGTCAACAACGCCTACTACACAAGTGGGTACTACTTGACTGACGGCATCTATCCCAATTGGCCTGTATTCGTGAAGAGTCCTACACATCCGACGGATCCGAAGGGGAAGAGGTTCAAAGTGATGCAGGAAGTGGCTCGCAAGGATATTGAACGAGCCTTCGGCGTCCTTCAAGCTCGTTGGGCAATCGTCAAAGGCCCATCGCGTCTTTGGAGCAAGGAGACGATGAGCGACATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990888
ATGGGGGTGCCGGTCACATATCAAGTCAACAACGCCTACTACACAAGTGGGTACTACTTGACTGACGGCATCTATCCCAATTGGCCTGTATTCGTGAAGAGTCCTACACATCCGACGGATCCGAAGGGGAAGAGGTTCAAAGTGATGCAGGAAGTGGCTCGCAAGGATATTGAACGAGCCTTCGGCGTCCTTCAAGCTCGTTGGGCAATCGTCAAAGGCCCATCGCGTCTTTGGAGCAAGGAGACGATGAGCGACATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771098.1
MGVPVTYQVNNAYYTSGYYLTDGIYPNWPVFVKSPTHPTDPKGKRFKVMQEVARKDIERAFGVLQARWAIVKGPSRLWSKETMSDIMFTCIILHNMIIEDEGEHATQWEEDADEASSSDASQPHAGAPPDFRAFVARQASMRDAEMHARLTLDLNEHICYVF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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