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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002691`

染色体: Chr06 坐标: 38830109-38831029 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002691`
名称	SmilChr06G002691
描述	RING-H2 finger protein ATL39-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	38830109 - 38831029 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989442`
GeneID	`130989442`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989442`
原始查询	`SmilChr06G002691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL39-like
产物	RING-H2 finger protein ATL39-like
Arabidopsis	`AT2G18670` (AT2G18670) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816382] identity=36.1; qcov=0.707; evalue=5.87e-19; confidence=low
Rice	`Os06g0271600` - identity=38.2; qcov=0.654; evalue=1.17e-21; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12678 (zf-rbx1); PF13639 (zf-RING_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989442

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057769437.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057769437.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057769437.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769437.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769437.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:38830380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B107,C26,C45
`Chr6:38830557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:38830692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:38830768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:38830855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C10
`Chr6:38830855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769437.1

188 aa

188

zf-RING_11

zf-RING_2

zf-rbx1

PF17123 zf-RING_11 92-121 aa PF13639 zf-RING_2 92-135 aa PF12678 zf-rbx1 96-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769437.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	92	121	7.4e-10	39.1	RING-like zinc finger
`XP_057769437.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	92	135	1.4e-12	48.4	Ring finger domain
`XP_057769437.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	96	135	5.9e-08	33.5	RING-H2 zinc finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913454.1
AATATTACAAAAAAAACTATAATATGAAGAGAACAATAAAATAATTAAATTCTCTTTTATTTTAAATCAATTTTTTAAAAAAAAATAAATACATATTTTTGAAGTATTTAACCATTTTTTGTGGGGGCATATTTTATTCAATAACTTTATTGATCAAAATAAGCACAAAAAAGTTCTTCCTATGCCACCAAATTCATTCATCTTATTACAACCAATCATCATCGTCTCTCTCTCTTGGAGATGCAGCATGATTAATGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989442
ATGTTTGAGATGGAAAAGCACAGCGTGGGTTTAGCAACACAGATATTGGTGATGGCGATAGTGATTTCAGTGATGTTGCTGTTTCTGGGCATGGGCGTTCTAGTCCTCATCCACGTCTGGATAGTGGGGCGGACGCTGCGCAACGGCGCTGCTACTGAGAGAAGCACCAACGCGGTGGAGAGAGAGAGCCTGGGGAGCACCAGCATGTCCCAAGACGACATCGAGAAGCTTCCGTGTTTCGACTTCGCCGCCAAGGCCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769437.1
MFEMEKHSVGLATQILVMAIVISVMLLFLGMGVLVLIHVWIVGRTLRNGAATERSTNAVERESLGSTSMSQDDIEKLPCFDFAAKASSPAADCAVCLESFRAGERCRLLPSCNHSFHAECVDLWLLRAPVCPICRAAAADDLVSILPPVYGGGGDDHERSGQSFQVVGILDNDNNSTHTQTTMDIDHV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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