当前解析结果
SmilChr06G002704| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002704 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002704 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002704 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 39020807 - 39021985 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990895 |
|---|---|
| GeneID | 130990895 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990895 |
| 原始查询 | SmilChr06G002704 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=29.4; qcov=0.704; evalue=9.46e-24; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990895 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057771106.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057771106.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057771106.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771106.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771106.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:39020812 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 12 | A7,B115,B139,B25,B74,B78,C18,C21,C22,C29,C44,C56 |
Chr6:39020827 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,B51 |
Chr6:39020867 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A7,B115,B139,B74,C18,C22,C29,C44,C56 |
Chr6:39020871 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B118,C2 |
Chr6:39020876 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,B124,B20,C58 |
Chr6:39020939 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B16,D2 |
Chr6:39020954 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A10,B48,C64,C66,D5 |
Chr6:39020954 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,B48,C64,C66,D5 |
Chr6:39020965 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr6:39021001 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,B51 |
Chr6:39021027 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A18,B122,B135,D10 |
Chr6:39021061 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B47,B62,C5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。