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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002708`

染色体: Chr06 坐标: 39079192-39082642 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002708`
名称	SmilChr06G002708
描述	uncharacterized SmilChr06G002708
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	39079192 - 39082642 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989394`
GeneID	`130989394`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989394`
原始查询	`SmilChr06G002708`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0730400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0730400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G23880` (AT1G23880) NHL domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838999] identity=53.1; qcov=0.931; evalue=2.71e-159; confidence=high
Rice	`Os02g0730400` - identity=55.4; qcov=0.966; evalue=4.25e-179; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01436 (NHL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989394

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057769356.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057769356.1`
3	Spore	Spore	0.20000	`XP_057769356.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769356.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:39079424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,B94
`Chr6:39079451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C81
`Chr6:39079473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:39079618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,C26,C45,C52,D11
`Chr6:39079650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:39079740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr6:39079745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr6:39079751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,C26,C45,C52
`Chr6:39079825`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A16,B131,B21,B64,B74,B83,C2,C26,C32,C45,C51,C52,C59,C68,C74,D1
`Chr6:39079841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C36
`Chr6:39079868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:39079915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B74,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769356.1

508 aa

254

508

NHL

PF01436 NHL 142-168 aa

XP_057769357.1

506 aa

253

506

NHL

PF01436 NHL 142-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769356.1`	Pfam	`PF01436`	NHL	Repeat	142	168	2.6e-08	34.2	NHL repeat
`XP_057769357.1`	Pfam	`PF01436`	NHL	Repeat	142	168	2.5e-08	34.2	NHL repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913373.1
GAATCTCAGCTTCATTACCTAAGTCTGTTATAAATTAAGACCACCTTTTAGTTGCTTCTCTCTCCTCATTCTTCAGTCACCTCAAGCTCTCTCTAATTTATGACTCGTGGGAAGTACACCACTAATGAGTAGTATATAAAAAGGGGAGGAATGTTGAGTTTTGGCATCCACATTTTCTTGAATCTCTCTGTTATTTGCTGAGTTTATTACACACAAAGAAAGAGGTGAAATGGGAAGAAAGAATTGCTTAGTTCTTGTTG...

XM_057913374.1
GTTATAAATTAAGACCACCTTTTAGTTGCTTCTCTCTCCTCATTCTTCAGTCACCTCAAGCTCTCTCTAATTTATGACTCGTGGGAAGTACACCACTAATGAGTAGTATATAAAAAGGGGAGGAATGTTGAGTTTTGGCATCCACATTTTCTTGAATCTCTCTGTTATTTGCTGAGTTTATTACACACAAAGAAAGAGGTGAAATGGGAAGAAAGAATTGCTTAGTTCTTGTTGTGATTCTCCTCATTTTTGTTGCTGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989394
ATGGGAAGAAAGAATTGCTTAGTTCTTGTTGTGATTCTCCTCATTTTTGTTGCTGGATGCTCACCAGCTTCTGCTTCACCTGCTACAAAAATCGTTGGTGGGGTTGTGACAAAGGTTGTCTCCACCATTTTCAAGCGGCTGTGGTCTCTCAAATCAGCCACCAAAACCGCTACCTCTAGCCGGTCGATGATGAAATTTGAAGGTGGATACAATGTTGAGACGGTGTTTGATGGAAGCAAGCATGGAATTGAGCCCTACAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769356.1
MGRKNCLVLVVILLIFVAGCSPASASPATKIVGGVVTKVVSTIFKRLWSLKSATKTATSSRSMMKFEGGYNVETVFDGSKHGIEPYTVEISPDEEVLILDSHNSNIYKIPTPLSRYSRPKLLAGSGEGYNGHVDGKLRQARLNHPRGLTVDDSGNVYVADTMNMAIRKISDSGVVTIAGGKLGRGGGHVDGPSEDAKFSDDFDLVYVGSSCSLLVIDRGNQAIREIQLHEHDCSHEEDNNLDLGIAVLAAACFFGYMLAL...

XP_057769357.1
MGRKNCLVLVVILLIFVAGCSPASASPATKIVGGVVTKVVSTIFKRLWSLKSATKTATSSRSMMKFEGGYNVETVFDGSKHGIEPYTVEISPDEEVLILDSHNSNIYKIPTPLSRYSRPKLLAGSGEGYNGHVDGKLRQARLNHPRGLTVDDSGNVYVADTMNMAIRKISDSGVVTIAGGKLGRGGGHVDGPSEDAKFSDDFDLVYVGSSCSLLVIDRGNQAIREIQLHEHDCSHEEDNNLDLGIAVLAAACFFGYMLAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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