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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002716`

染色体: Chr06 坐标: 39238300-39240924 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002716`
名称	SmilChr06G002716
描述	probable inactive receptor kinase At2g26730
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	39238300 - 39240924 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989389`
GeneID	`130989389`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989389`
原始查询	`SmilChr06G002716`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive receptor kinase At2g26730
产物	probable inactive receptor kinase At2g26730
Arabidopsis	`AT5G58300` (AT5G58300) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835942] identity=34.7; qcov=0.992; evalue=7.59e-93; confidence=low
Rice	`Os09g0376600` - identity=33.5; qcov=1.06; evalue=2.58e-94; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989389

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769348.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769348.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769348.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769348.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769348.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:39238711`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A18,B11,B139,B17,B26,B27,B29,B37,B57,B82,B97,C20,C34,C40,C44,C50,C63,C7,D8
`Chr6:39238716`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	19	A18,B11,B139,B17,B26,B27,B29,B37,B57,B82,B97,C20,C34,C40,C44,C50,C63,C7,D8
`Chr6:39238788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C12,C62
`Chr6:39238821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,C11,C69,C9
`Chr6:39238977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,C40,C65
`Chr6:39239064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C26
`Chr6:39239084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B63,B83
`Chr6:39239124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C57
`Chr6:39239126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:39239144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:39239233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr6:39239446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769348.1

648 aa

324

648

LRRNT_2

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 28-68 aa PF00560 LRR_1 150-167 aa PF00069 Pkinase 359-619 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 359-620 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769348.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	28	68	2.4e-07	31.6	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057769348.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	150	167	2.1e-08	33.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057769348.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	359	619	2.1e-24	87.0	Protein kinase domain
`XP_057769348.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	359	620	1.1e-27	97.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913365.1
ATTTTTGACATGTGAAATTGGGAATTTTTAAATATTAACTCAACCTCAAATCCAATAACCACAATCCAAATTCAACATGATGATAAACATAAGACAATCACCTCAGCTCTATCAATCCTATTCAAGAATGAAATCAAAAAAACAATAATTACTACGATGATTACTACACCTAAATGAGGCTGAAAACGTCGTCGTCTTGTCGTCCAAGAATCATTCAACTCAAAATGACGATTCTCGCCGGCACCTTCCATTCCATTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989389
ATGAAGCAAACCTCAATCTTCGCCTGCGCTGTTTCACTTCTCCTCCTCCTCCGCTTAGCGGAATCCGAGGAGAATCTAGTGCGAGATTCCCTGCTCGACTTCTTCTCCAAACTCTCCAACAACAAGAGCATCTCCGCCCCCGGCTCCGGCTGGAACTCCACCTCCGACCCCTGCCGCGACAGCTGGCGAGGGGTCACGTGCGATCCTCTCCTGCACGTGCAGGAGATCCACCTCGGCGGCCTCGGCCTCCGAGGCGTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769348.1
MKQTSIFACAVSLLLLLRLAESEENLVRDSLLDFFSKLSNNKSISAPGSGWNSTSDPCRDSWRGVTCDPLLHVQEIHLGGLGLRGVFDPGTLCNERSLSQSLSTINVAGNALRGENLPAIANCSDLAHLDLSSNQFATAQLGDSIPRLNNLQTLDLSSNMIPGSLPDLSQMHALTKFKAQQNDFSGAIPDLDFSRFGEFNVSHNSLSGSIPFGARGLPPSSFFDNPELCGPPLPRSCSQAAAEESTPDAAPLPPPPPRRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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