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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002722`

染色体: Chr06 坐标: 39330474-39332010 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002722`
名称	SmilChr06G002722
描述	peroxidase 31-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	39330474 - 39332010 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989424`
GeneID	`130989424`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989424`
原始查询	`SmilChr06G002722`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxidase 31-like
产物	peroxidase 31-like
Arabidopsis	`AT3G28200` (AT3G28200) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822446] identity=62.7; qcov=0.911; evalue=9.4e-150; confidence=high
Rice	`Os02g0741200` (prx31) - identity=53.4; qcov=0.964; evalue=8.22e-127; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989424

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057769410.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057769410.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769410.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769410.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769410.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:39330880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:39331008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C87
`Chr6:39331009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C87
`Chr6:39331014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C87
`Chr6:39331015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C87
`Chr6:39331048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B52,B55,C12
`Chr6:39331056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B52,B55,C12
`Chr6:39331111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C34
`Chr6:39331156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr6:39331180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B131,B64,B83,C59
`Chr6:39331217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B109,B97,C63,C76
`Chr6:39331225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B109,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769410.1

336 aa

168

336

peroxidase

PF00141 peroxidase 55-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769410.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	55	299	9.5e-78	262.0	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913427.1
TAAATAAAAGCGCATTAAGCCTTTGAACACGGCGATGAGTAAAATAATTGCGGATTTGGGATTTGATTTGTCACAAACAAAACAACACAAAAACAGAGCCCTGCCACGTAGGCTGATCCAGCATGAAAGTGGGGCCCGCTTCCAGCCCACAACATCCGTGATTAGTGCTGGAGACAGCGGCGCGTCGCGTGCACGCACCCACCATATCCTAATCTCCAAGCCTCTCTCTCTCACAACCTCAAAACTCTAAACCCTCGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989424
ATGGCGTCGCCACTGCTTCAGCTGCTCGCGCTCTCCGTCCTCCTCCTACTCGGCCCCGCCGCCGAAGCCGCGGGGAAGGGGCGGCGGAGCCAGCCGTACCTGAGCACCACGTACTACAGCAAGTCCTGCCCCAAATTCGAGAAGATCGTGCAGGACACCACCACCGACAAGCAGATCTCCTCCCCCACCACCGCCGCCGCAGCGCTCCGCCTCTTCTTCCACGACTGCTTCGTCGGCGGATGCGACGCCTCCGTCCTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769410.1
MASPLLQLLALSVLLLLGPAAEAAGKGRRSQPYLSTTYYSKSCPKFEKIVQDTTTDKQISSPTTAAAALRLFFHDCFVGGCDASVLVSSTRFSKAERDADINLSLPGDGFDVVVRAKTALELNCPGVVSCADILAVATRNLVVMMGGPFYPVKLGRKDALASRAADVEGNLPRPTMPMSQIIQIFQSKGFSIQEMVALSGAHTIGFSHCKEFSSNLYNYSKTSESDPAYYPEFARSLRNACADYHRNPTLSVFNDVITPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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