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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002725`

染色体: Chr06 坐标: 39359461-39359985 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002725`
名称	SmilChr06G002725
描述	cation/calcium exchanger 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	39359461 - 39359985 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990899`
GeneID	`130990899`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990899`
原始查询	`SmilChr06G002725`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cation/calcium exchanger 1-like
产物	cation/calcium exchanger 1-like
Arabidopsis	`AT5G17860` (CAX7) calcium exchanger 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831654] identity=40.6; qcov=0.977; evalue=1.24e-32; confidence=medium
Rice	`Os03g0180000` (OsCCX1) - identity=39.9; qcov=0.764; evalue=9.53e-21; confidence=medium
GO	GO:0006812 (monoatomic cation transport); GO:0008324 (monoatomic cation transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01699 (Na_Ca_ex)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990899

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057771110.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057771110.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057771110.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771110.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771110.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:39359487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B124,B51,C40,C65
`Chr6:39359488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B52,C16,D4
`Chr6:39359583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	52	A19,A25,A3,B1,B103,B11,B119,B131,B135,B140,B2,B21,B23,B33,B46,B56,B61,B63,B64,B67,B72,B78,B81,B83,B85,B86,B91,B94,B96,B97,B99,C14,C19,C2,C22,C32,C33,C46,C49,C58,C59,C61,C64,C66,C68,C8,C82,C85,D1,D11,D6,D7
`Chr6:39359585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:39359604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:39359611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C74
`Chr6:39359735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr6:39359739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr6:39359757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D1
`Chr6:39359848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C74
`Chr6:39359863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B40
`Chr6:39359869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771110.1

174 aa

174

Na_Ca_ex

PF01699 Na_Ca_ex 1-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771110.1`	Pfam	`PF01699`	Na_Ca_ex	Family	1	118	1.6e-16	61.3	Sodium/calcium exchanger protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915127.1
ATGGAGAGCTTGTCGCGCGTGTTGAGGCTGTCCCCGACCATCGCCAGGACCACGCTTCTCCCGCTGGGGAACGACGCCAACGACGTCTTCTCCAGCGTGATCGCGTTCACGCGCTCCGGCGACGCCGACGTCGGCCTCAGCAGCGTCCTCGGTGGTGCCTTCTTTATCTCGTGCTTCGTCGTCGGCGTGGTGAGCATCGCGGGAGGTGCGCGTGGACAAGGCGAGCTTCGTGAGGGATGTGTTATTCTTCCTCTTTGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990899
ATGGAGAGCTTGTCGCGCGTGTTGAGGCTGTCCCCGACCATCGCCAGGACCACGCTTCTCCCGCTGGGGAACGACGCCAACGACGTCTTCTCCAGCGTGATCGCGTTCACGCGCTCCGGCGACGCCGACGTCGGCCTCAGCAGCGTCCTCGGTGGTGCCTTCTTTATCTCGTGCTTCGTCGTCGGCGTGGTGAGCATCGCGGGAGGTGCGCGTGGACAAGGCGAGCTTCGTGAGGGATGTGTTATTCTTCCTCTTTGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771110.1
MESLSRVLRLSPTIARTTLLPLGNDANDVFSSVIAFTRSGDADVGLSSVLGGAFFISCFVVGVVSIAGGARGQGELREGCVILPLCVGCIIMINIFERINFWFVLCFFSIYFLYIALVSVMQFLQRKEATVGHSQGLDDFGDVEMPLYDYAHEEKASLFRTNQRISANLSVVAT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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