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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002738`

染色体: Chr06 坐标: 39643922-39644277 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002738`
名称	SmilChr06G002738
描述	uncharacterized SmilChr06G002738
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	39643922 - 39644277 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990903`
GeneID	`130990903`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990903`
原始查询	`SmilChr06G002738`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0629600` - identity=35.3; qcov=0.654; evalue=2.72e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990903

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771113.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771113.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057771113.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771113.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771113.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:39643937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C51,C74
`Chr6:39643937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C74
`Chr6:39643964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C16,D4
`Chr6:39644001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:39644072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C33,C36,C46,C7
`Chr6:39644141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,B85,B94
`Chr6:39644192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B131,B76,C27,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771113.1

104 aa

104

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 6-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771113.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	6	96	1.4e-13	51.7	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915130.1
ATGTCTTCCACATTGCAGCTACAACATCAGTCCTTCGAGACTGCGGCTGCAATAATGGTGAACCTTGAGGAGCTCTTCGGGGAAACTGACCGTTCAGTCCGTTTTAAAATCATGACGAAACTTATGGCTTCGAGGATGACGGAGGGTTCACCTGTGCACGAGCATGTGCTCGAAATGATTAATCATTTCAATGAGCTGGAAATGCTCGGTGGAGGTATCGAAGATGATATCAAGGTTGATATGGTACTCCACACTCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990903
ATGTCTTCCACATTGCAGCTACAACATCAGTCCTTCGAGACTGCGGCTGCAATAATGGTGAACCTTGAGGAGCTCTTCGGGGAAACTGACCGTTCAGTCCGTTTTAAAATCATGACGAAACTTATGGCTTCGAGGATGACGGAGGGTTCACCTGTGCACGAGCATGTGCTCGAAATGATTAATCATTTCAATGAGCTGGAAATGCTCGGTGGAGGTATCGAAGATGATATCAAGGTTGATATGGTACTCCACACTCTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771113.1
MSSTLQLQHQSFETAAAIMVNLEELFGETDRSVRFKIMTKLMASRMTEGSPVHEHVLEMINHFNELEMLGGGIEDDIKVDMVLHTLPKSYENFRLNAIMGKKKG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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