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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002744`

染色体: Chr06 坐标: 39842685-39845697 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002744`
名称	SmilChr06G002744
描述	uncharacterized SmilChr06G002744
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	39842685 - 39845697 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989498`
GeneID	`130989498`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989498`
原始查询	`SmilChr06G002744`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815012]; symbol=AT2G04690; hit=AT2G04690; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815012]; symbol=AT2G04690; hit=AT2G04690; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G04690` (AT2G04690) Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815012] identity=64.3; qcov=0.774; evalue=1.84e-82; confidence=high
Rice	`Os06g0238300` - identity=66.9; qcov=0.644; evalue=9.08e-76; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13883 (CREG_beta-barrel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989498

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057769461.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057769461.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769461.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769461.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769461.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:39844124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B79,C18,C73,C86
`Chr6:39845339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769461.1

239 aa

120

239

CREG_beta-barrel

PF13883 CREG_beta-barrel 63-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769461.1`	Pfam	`PF13883`	CREG_beta-barrel	Domain	63	224	5.5e-58	196.4	CREG, beta-barrel

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913478.1
AGACTCATCATTTTACTTTACCGTCGCGCTCTTCCACAATCAACGATTTTAAATGATTAAATCCTAATTAAGTAAATAGGAAATATAAAATTATTTTAGAATTTTTAATAGTATTTCTATAAATCAATTAAATAAAAATTCTCAATTATTACGTTGTCGCCTCCAAATAGACGAGCTATAGATGGATGAGAAGGAAGTGTCGAACTGTAGTATTTCGTCAGCTTCTTCCCATTATTAGACTGATAGAAGCAACAATCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989498
ATGAGAAGGAAGTGTCGAACTGTAGTATTTCGTCAGCTTCTTCCCATTATTAGACTGATAGAAGCAACAATCTTCGAGAAAATGAAAATCAAAGGCTTCATTTATTACTTCGTTTTGGCATTTTTCGAATTGCTTCAGCAATCCGTACAAGGGCGGCCGTTGCTGACGTCAACGCCCAGGCCTTGGCGTGATGATACGGCGTCGTTTGCCAGGTGGTTGGTTTCCCAGAATTCATGGGGTGTACTAAACACGATATCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769461.1
MRRKCRTVVFRQLLPIIRLIEATIFEKMKIKGFIYYFVLAFFELLQQSVQGRPLLTSTPRPWRDDTASFARWLVSQNSWGVLNTISGDWGGAPFGNVVSFSDGLPDEGRGIPYFYLTTLDPTARNALEDQRASFTLSEYNLGTCGKKDPEDPSCAKITIGGKLNPLEGNPDEDEFARTALFTKHPAMKGWPKGHNFQIFKLDVENIFLINWFGGAKPITVEDYLNADMNEHAFDARLTA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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