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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002767`

染色体: Chr06 坐标: 40275414-40277411 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002767`
名称	SmilChr06G002767
描述	protein transport protein SEC13 homolog B-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	40275414 - 40277411 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989520`
GeneID	`130989520`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989520`
原始查询	`SmilChr06G002767`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein transport protein SEC13 homolog B-like
产物	protein transport protein SEC13 homolog B-like
Arabidopsis	`AT2G30050` (AT2G30050) transducin family protein / WD-40 repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817556] identity=80.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0135800` (OsWD40-36) - identity=81.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006606 (protein import into nucleus); GO:0030127 (COPII vesicle coat); GO:0031080 (nuclear pore outer ring); GO:0090114 (COPII-coated vesicle budding)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989520

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057769472.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.80000	`XP_057769472.1`
3	Nuclear pore complex	核孔复合体	0.60000	`XP_057769472.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769472.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057769472.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:40276481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C84,D11
`Chr6:40276908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769472.1

301 aa

150

301

WD40

PF00400 WD40 7-37 aa PF00400 WD40 46-84 aa PF00400 WD40 93-131 aa PF00400 WD40 146-190 aa PF00400 WD40 204-240 aa PF00400 WD40 256-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769472.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	7	37	1.5e-34	117.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769472.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	46	84	1.5e-34	117.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769472.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	93	131	1.5e-34	117.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769472.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	146	190	1.5e-34	117.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769472.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	204	240	1.5e-34	117.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769472.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	256	285	1.5e-34	117.7	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913489.1
ATAAAATCCGAAAACTTAATGGGACAGACCTATCCAAGTAACCAAACACGTCCTCAATTTATAACGCATATCGCTTGTGCTTTATAGAGTTGTACGATTGCAATTCCCCTCCGTCATTGAGCTGTAGCATTGTCTCCTCACCGATTTCCTCTTCGCACCCGATCTGCTCCGAAGCTCCAATCGACATATTCCTGGGGTGTCAAAGCAAACCTTAAAGCAATTCTACCAAGGTCGAAGGTATATAGCCAATAAGAAAGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989520
ATGCCTCCACAGAAAATAGAAACAGGCCACAATGATGTTGTTCATGATGTGTCGATGGATTATTATGGAAAACGTGTGGCAACGGCTTCATCAGATGGCACTATAAAAATAATTGGCGTGAGCAACAACTCTTCGCAGCATCTGGCTACTCTGACTGGTCATCAAGGTCCGGTATGGCAGGTAATTTGGGCACACCCCAAGTTTGGCTCGACACTGGCTTCTTGTTCTTATGACGGTAAAGTCATCATCTGGAAGGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769472.1
MPPQKIETGHNDVVHDVSMDYYGKRVATASSDGTIKIIGVSNNSSQHLATLTGHQGPVWQVIWAHPKFGSTLASCSYDGKVIIWKEGNPNEWSQAHIFSDHKSSVNSIAWAPHELGLCLACGSSDGNISVYTSRSDGGWDTTKIDQAHPVGVTSVTWAPSMAPGALVGSGVLEPVQKLASGGCDNTVKIWKLYNGIWKMDCFPALQNHSDWVRDVSWAPNLGLPKSTVASASQDGTVVIWTVAKEGDQWEGKVLKDFKTP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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