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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002793`

染色体: Chr06 坐标: 40621670-40623770 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002793`
名称	SmilChr06G002793
描述	pre-mRNA-processing-splicing factor 8A-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	40621670 - 40623770 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989539`
GeneID	`130989539`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989539`
原始查询	`SmilChr06G002793`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA-processing-splicing factor 8A-like
产物	pre-mRNA-processing-splicing factor 8A-like
Arabidopsis	`AT1G80070` (SUS2) Pre-mRNA-processing-splicing factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844347] identity=92.3; qcov=0.953; evalue=4.29e-111; confidence=high
Rice	`Os06g0167000` - identity=92.9; qcov=0.953; evalue=1.32e-113; confidence=high
GO	GO:0000244 (spliceosomal tri-snRNP complex assembly); GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005682 (U5 snRNP); GO:0017070 (U6 snRNA binding); GO:0030619 (U1 snRNA binding); GO:0030620 (U2 snRNA binding); GO:0030623 (U5 snRNA binding); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome); GO:0097157 (pre-mRNA intronic binding)
KEGG	-
Pfam	PF10596 (U6-snRNA_bdg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989539

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769499.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769499.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769499.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769499.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769499.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:40622940`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B68
`Chr6:40622940`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B68
`Chr6:40622961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr6:40622970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B35
`Chr6:40623111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C9
`Chr6:40623295`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B1
`Chr6:40623295`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769499.1

191 aa

191

U6-snRNA_bdg

PF10596 U6-snRNA_bdg 1-79 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769499.1`	Pfam	`PF10596`	U6-snRNA_bdg	Domain	1	79	5.9e-44	150.4	U6-snRNA interacting domain of PrP8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913516.1
CGGTTTCACTCTCCCTCCCCCCGTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTTCGAGCTCAGATCGCCGGCGAAGCGCCGCTGCCCCAGCCTCGTCGCCTCCGCCATCTCCTGCTTCATCCCCCGCCGCGACATTAGCCTCCGCCCGCCACCAATTCCTTCGAAGCAGAGGAGGATGAGTGCGGTGGCGCTTCGAGTTCCGCGAGGTTTTCCCCCTTCGCCGCCAGCGATTCGGCGTCCTTGTTGCCGATTTTCAATTTTCCGGTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989539
ATGAAGTACAAGAAGTTAACTAATGCACAAAGATCTGGTCTCAACCAAATTCCTAACAGAAGATTTACACTTTGGTGGTCGCCGACTATAAACAGAGCAAACGTGTATGTTGGTTTCCAAGTCCAGCTGGATCTCACTGGGATCTTTATGCATGGGAAGATACCAACTCTGAAGATATCTCTGATCCAGATACATGAGAGTGTAGTGATGGATCTCTGTCAAGTTTTGGATCAGGAGCTGGATGCGTTGGAAATTGAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769499.1
MKYKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIHESVVMDLCQVLDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCSDILLFAAHRWPMSKPSLVAESKDVFDQKASNKYWIDVQLRWGYYDSHDIERYTRAKFMDYTTDNMSISFFTTCIVCLRLNQSLVL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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