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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002794`

染色体: Chr06 坐标: 40629539-40631772 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002794`
名称	SmilChr06G002794
描述	uncharacterized SmilChr06G002794
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	40629539 - 40631772 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990916`
GeneID	`130990916`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990916`
原始查询	`SmilChr06G002794`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288]; symbol=AT2G07190; hit=AT2G07190; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288]; symbol=AT2G07190; hit=AT2G07190; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G07190` (AT2G07190) transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288] identity=30; qcov=0.213; evalue=2.31e-06; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990916

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771127.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057771127.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057771127.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771127.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771127.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:40630235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C47
`Chr6:40630237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C47
`Chr6:40630282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A1,B103,B129,B2,B9,C12,C47,D2
`Chr6:40630324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B113,B42,B9,D2
`Chr6:40630328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B83,B95,C35,C59
`Chr6:40630749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B79,B8,C49,C80
`Chr6:40630861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr6:40630906`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B47,C33,C58,C85,D1
`Chr6:40630906`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B47,C33,C58,C85,D1
`Chr6:40630942`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D9
`Chr6:40630942`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D9
`Chr6:40630962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915144.1
CTATTAATGTAACTTCGGACGTGGGCACTTATTATAAAATCAAGTATTTAGACAAAGTGAAGAAAAATTTAAAGGATAAAGGTGGTGAACAATTGTTAAATAGATTTTTACGGGGTTGTTTTGGTCATTTATTGGATTGGAATCCTGGTCCGAAATGTGCAATGGCCGTTCATCAAGTAGTCTCTCGCCAAATAAAGTCAAGCCGTGATGGTCTTTTCTTTTTATTGAATAATACGATAGTTCATTTTTCAAAGAGGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990916
ATGATCTTTGATGCATTTAACCAATTTCCGTGGGGGGCGTATACGTATAATAGATTGTGTTACTATACGACAAAGTGCAAGTCTAAAAAACATCATAAATTGTATGGACCTGTTTGGGCGTTGCATGTGTGGTCGCTTGAGATTATGCCCGATTTAGGTAATGTGGTCGGTAATTGTGTTGCTGAGTTTGCGCACCCTAGATGTTTGAAGTGGAAGTTTCGTAGTAGACCGGCTACGAAGGATTTACGGCCCTTCTTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771127.1
MIFDAFNQFPWGAYTYNRLCYYTTKCKSKKHHKLYGPVWALHVWSLEIMPDLGNVVGNCVAEFAHPRCLKWKFRSRPATKDLRPFFEKEEQEILELVADEFEVSTMYYLSTIGVYMGAQHDEPRVYMGAQHDEAPNQDFPYGPSHDIHVQEQEQEEGGALHDIPISAHDLAATVMDTWARSSSSHEEGRRRRAREKRVRPPTTSSSSSSGDHANRRVDREYMETVVRRMDEAHEERMKRHSDALHERVKGTLKGFFEELK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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