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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002810`

染色体: Chr06 坐标: 40804176-40804733 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002810`
名称	SmilChr06G002810
描述	probable calcium-binding protein CML46
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	40804176 - 40804733 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990923`
GeneID	`130990923`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990923`
原始查询	`SmilChr06G002810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable calcium-binding protein CML46
产物	probable calcium-binding protein CML46
Arabidopsis	`AT5G39670` (AT5G39670) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833963] identity=41; qcov=1.03; evalue=1.36e-37; confidence=medium
Rice	`Os11g0600500` - identity=36.4; qcov=0.697; evalue=5.5e-21; confidence=medium
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF13202 (EF-hand_5); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990923

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057771131.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057771131.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771131.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771131.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:40804266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:40804304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr6:40804342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:40804374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,C27,C31,C56,C65
`Chr6:40804402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C21
`Chr6:40804690`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B37,B38,B39,B55,B70,B82,C20,C71,C75,C78,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771131.1

185 aa

185

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_6

EF-hand_7

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_5

PF13833 EF-hand_8 113-138 aa PF00036 EF-hand_1 117-142 aa PF13405 EF-hand_6 117-146 aa PF13499 EF-hand_7 118-180 aa PF13202 EF-hand_5 119-142 aa PF13833 EF-hand_8 133-182 aa PF00036 EF-hand_1 156-182 aa PF13202 EF-hand_5 160-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771131.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	113	138	3.5e-09	37.0	EF-hand domain pair
`XP_057771131.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	117	142	1.1e-14	53.5	EF hand domain
`XP_057771131.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	117	146	3.3e-12	45.7	EF-hand domain
`XP_057771131.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	118	180	2.4e-13	50.9	EF-hand domain pair
`XP_057771131.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	119	142	2e-10	40.4	EF hand
`XP_057771131.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	133	182	3.5e-09	37.0	EF-hand domain pair
`XP_057771131.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	156	182	1.1e-14	53.5	EF hand domain
`XP_057771131.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	160	180	2e-10	40.4	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915148.1
ATGTCTGCAGTCACCAATTTGAACGAGTTCCCACTTCACGAAATATCCACAAACATGAGCACCATCAAATTGTGCCTTCTGATAGTGGGGCTGATCAAGTTCTCGCTGGTGCAAATCCTCCTCCACAGGAGAAGGATCTCCCTCTTCTTTCGATCATCGGAACCCCGCGATCATCGCGATACGAAGAAAACTGCTGCTGCTGATGATGATGATGAGAGCGTGTGTGGAGGAGAAGACGTGGAGATGATCATGACAAGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990923
ATGTCTGCAGTCACCAATTTGAACGAGTTCCCACTTCACGAAATATCCACAAACATGAGCACCATCAAATTGTGCCTTCTGATAGTGGGGCTGATCAAGTTCTCGCTGGTGCAAATCCTCCTCCACAGGAGAAGGATCTCCCTCTTCTTTCGATCATCGGAACCCCGCGATCATCGCGATACGAAGAAAACTGCTGCTGCTGATGATGATGATGAGAGCGTGTGTGGAGGAGAAGACGTGGAGATGATCATGACAAGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771131.1
MSAVTNLNEFPLHEISTNMSTIKLCLLIVGLIKFSLVQILLHRRRISLFFRSSEPRDHRDTKKTAAADDDDESVCGGEDVEMIMTRLGFSGQEKLPAKMGAGEIFQIFEEREPSLGEVREAFDVFDEKRDGFIDEKELQKVMCALGFKEGMEMENCRRMIEAVDQDGDGRIGFHEFLKFMENTFA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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