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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002829`

染色体: Chr06 坐标: 41066992-41069493 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002829`
名称	SmilChr06G002829
描述	uncharacterized SmilChr06G002829
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41066992 - 41069493 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989575`
GeneID	`130989575`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989575`
原始查询	`SmilChr06G002829`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	axoneme-associated protein MST101(2) protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819091]; symbol=AT2G44820; hit=AT2G44820; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	axoneme-associated protein MST101(2) protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819091]; symbol=AT2G44820; hit=AT2G44820; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G44820` (AT2G44820) axoneme-associated protein MST101(2) protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819091] identity=58.5; qcov=0.672; evalue=1.3e-38; confidence=medium
Rice	`Os01g0224500` - identity=53.6; qcov=0.601; evalue=9.32e-26; confidence=medium
GO	GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005730 (nucleolus)
KEGG	-
Pfam	PF15375 (FSAF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989575

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769536.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057769536.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.60000	`XP_057769536.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057769536.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769536.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41069190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:41069199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B47,B71
`Chr6:41069313`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A1,B19,B55,C23,C54
`Chr6:41069313`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A1,B19,B55,C23,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769536.1

183 aa

183

FSAF1

PF15375 FSAF1 8-104 aa

XP_057769537.1

183 aa

183

FSAF1

PF15375 FSAF1 8-104 aa

XP_057769538.1

183 aa

183

FSAF1

PF15375 FSAF1 8-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769536.1`	Pfam	`PF15375`	FSAF1	Family	8	104	1.6e-15	58.3	40S small subunit processome assembly factor 1
`XP_057769537.1`	Pfam	`PF15375`	FSAF1	Family	8	104	1.6e-15	58.3	40S small subunit processome assembly factor 1
`XP_057769538.1`	Pfam	`PF15375`	FSAF1	Family	8	104	1.6e-15	58.3	40S small subunit processome assembly factor 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913553.1
AATTAATTAAAATATAACAAAACGAGACGTCGCCCAGTTGCCTCCAGTGCCTCGGCCCTCCGGCCTCCTCCTTAGCCGCCGCCCGGCCCGTCCCTGAACCCGTTGCAGCCTTCCCCTTCAGTTAGGAGAAAGTTCTGAAATTGCAATGAAGGGGAAAGAAACGAAGAGGGGGTCCTCATCCACTAATTTGGATTCCCACGAACCCAGAATGGACATCAAGTCCATTCTGAAAGATATTGAATTTTTGGGATCCTCACACA...

XM_057913554.1
GCTTAAAATTTCCTTTGATATGAGTGAATGTAGTTACTGTATTGTTTTGAGTGAGAGAATTAGAAAATCAGTTTTTATTTAGTTTAGACAGGAAGATGGAGAATCGAAGAGGGCAGCCTTTGGTATGCTGCCAAGTTTTTTTAAATTATTTAATTCGGTTATCCGAAATACCGATGGCTTGGGTTTTGGTTCGAACTTCTAAAACCCCAGGCCCAATCCTCCCTTGGATTCCGCCACCGCTGCTCTCCTTTCCTTTTCTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130989575
ATGAAGGGGAAAGAAACGAAGAGGGGGTCCTCATCCACTAATTTGGATTCCCACGAACCCAGAATGGACATCAAGTCCATTCTGAAAGATATTGAATTTTTGGGATCCTCACACATGACATGGAAACAGAAAAAGGACTTGGAGAATAAGAAGGTAGTGTCACTTGGTGGAAAGCCTCCAAAGAAACAGAGGTTACCTCTTAGTGTTGCAAGAGTTGCAATGAAGAATCAAAAGGGAAGAGAAGAAAAAATGCTTCAAGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057769536.1
MKGKETKRGSSSTNLDSHEPRMDIKSILKDIEFLGSSHMTWKQKKDLENKKVVSLGGKPPKKQRLPLSVARVAMKNQKGREEKMLQERAILGRFGAYSSSSSKKVAERRPAEDRILKSIQGNFRKGVLNVEHLLQPSAPEASNDMGRHPTGKGKKKKKKKKKKKDNGKKSHGKRKGGGGKKRH

XP_057769537.1
MKGKETKRGSSSTNLDSHEPRMDIKSILKDIEFLGSSHMTWKQKKDLENKKVVSLGGKPPKKQRLPLSVARVAMKNQKGREEKMLQERAILGRFGAYSSSSSKKVAERRPAEDRILKSIQGNFRKGVLNVEHLLQPSAPEASNDMGRHPTGKGKKKKKKKKKKKDNGKKSHGKRKGGGGKKRH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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