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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002834`

染色体: Chr06 坐标: 41125081-41125962 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002834`
名称	SmilChr06G002834
描述	uncharacterized SmilChr06G002834
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41125081 - 41125962 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990942`
GeneID	`130990942`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990942`
原始查询	`SmilChr06G002834`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=27.7; qcov=0.765; evalue=4.41e-25; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=30.7; qcov=1.04; evalue=8.44e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990942

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771146.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771146.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771146.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771146.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771146.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41125082`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	99	A14,A18,A22,A23,A3,A4,A5,A8,B10,B100,B103,B105,B107,B108,B109,B11,B113,B115,B118,B120,B124,B128,B134,B138,B15,B22,B24,B26,B29,B34,B35,B37,B4,B40,B45,B49,B50,B52,B53,B59,B64,B67,B68,B69,B7,B71,B73,B75,B77,B78,B81,B82,B84,B87,B93,B98,B99,C16,C17,C19,C22,C23,C25,C26,C29,C32,C35,C38,C40,C42,C43,C45,C46,C5,C51,C52,C53,C54,C57,C60,C62,C63,C64,C66,C68,C70,C71,C76,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D10,D2,D3,D9
`Chr6:41125091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C33
`Chr6:41125096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C69,D10
`Chr6:41125102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr6:41125117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B5,C43,C46
`Chr6:41125138`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A10,B106,B11,B114,B118,B123,B126,B129,B134,B135,B136,B137,B138,B17,B26,B3,B32,B39,B46,B58,B74,B86,C19,C27,C48,C52,C54,C58,C60
`Chr6:41125144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B67,B96
`Chr6:41125184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr6:41125185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:41125210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B16,C61,C75
`Chr6:41125213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C75
`Chr6:41125234`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771146.1

293 aa

146

293

DBD_Tnp_Mut

PF03108 DBD_Tnp_Mut 71-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771146.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	71	133	3.1e-08	33.9	MuDR family transposase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915163.1
ATGAGAAAGAAACTAAAAACGACTGATAGTGTTTTTAAGTTGATTAATGAAAAAGATGGCTTTGAAGCCGAAGTGGAACACACATACCATTCTGATTATGAAAATGATGAAAAGGAATTTGCCTCCGATGAAACAGATTCTGACTTCGAACATTCGTTGAGGGTAAAGAAAGTTGTTTATGATCCTAGCTATGACCATAGCAAAATGCAGCCTGTCATTGGCATGTATTTCCAGGATGGGATTCAATGTAGGACGGCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990942
ATGAGAAAGAAACTAAAAACGACTGATAGTGTTTTTAAGTTGATTAATGAAAAAGATGGCTTTGAAGCCGAAGTGGAACACACATACCATTCTGATTATGAAAATGATGAAAAGGAATTTGCCTCCGATGAAACAGATTCTGACTTCGAACATTCGTTGAGGGTAAAGAAAGTTGTTTATGATCCTAGCTATGACCATAGCAAAATGCAGCCTGTCATTGGCATGTATTTCCAGGATGGGATTCAATGTAGGACGGCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771146.1
MRKKLKTTDSVFKLINEKDGFEAEVEHTYHSDYENDEKEFASDETDSDFEHSLRVKKVVYDPSYDHSKMQPVIGMYFQDGIQCRTALTTWAIENGRYVRFKAVSKKKLLAKCTPPCPWNLYASSLRANGTFMIKSGAWDHTCAKAMSNKLLSSQWIASRYLNVYRVSYNLSVKDLGADILERFKVRVPKDRLYKARRMAQEMVRGSVHQHYAMIKNYVAELRKVDPEGRFELLLEADNTFKALYIGLSAPRKGFKVSCRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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