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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002839`

染色体: Chr06 坐标: 41158545-41159776 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002839`
名称	SmilChr06G002839
描述	uncharacterized SmilChr06G002839
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41158545 - 41159776 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989585`
GeneID	`130989585`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989585`
原始查询	`SmilChr06G002839`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824499]; symbol=AT3G53310; hit=AT3G53310; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824499]; symbol=AT3G53310; hit=AT3G53310; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G53310` (AT3G53310) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824499] identity=32; qcov=0.46; evalue=7.32e-09; confidence=low
Rice	`Os12g0591500` - identity=27.2; qcov=0.592; evalue=1.25e-08; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989585

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769548.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769548.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769548.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769548.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769548.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41159080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C35
`Chr6:41159099`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C74
`Chr6:41159099`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C74
`Chr6:41159102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B16,B88,C67
`Chr6:41159166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr6:41159249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B25,C27,C56,C65
`Chr6:41159264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B124,C22
`Chr6:41159306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:41159308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C37
`Chr6:41159321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B110,B88,C22
`Chr6:41159331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B110,B88,C22
`Chr6:41159334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B110,B88,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769548.1

211 aa

106

211

PF02362 B3 18-99 aa PF02362 B3 127-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769548.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	18	99	8.4e-27	93.8	B3 DNA binding domain
`XP_057769548.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	127	195	8.4e-27	93.8	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913565.1
CATGGCCAGATCGAGATACCAAATGTAGTGAAAAGTTGCAGTAAATGTTTTTATGAAGAATCGTGAGTAAACTCAGATTATAGATAGAGATAAGAAAGGGAGCTAGCTACGAAGAAGAAGAAGGGGAGGAATTGTGCATGGGCTTTGCCCTAATAATGTGGTCCCACATTACAGCTGTCTCCTCCAATCCCACCGTCAAAAACGTGACACGTGGATGGCTAGGATCAGCTGACTTTAGCCACTCTCTTCCTCTCATTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989585
ATGGACACGAGGCCTTCATTTTACAAGATCTTGATGGACCTCCCTCCCAAACTCCTATTGCCAAAGGGTTTCACGGATAAGTACGGCGAAAACTTGTCCGAAAGAGTTAGGCTAAGAAACAAGAGCGGCACCTCATGGAATGTGAGGCTCGAGAAAATGAGAGAAGAAGGAGAAGAAACCGATGCTTACTACTTCACGAGAGGATGGACCAAATTCTGTAATGACGTGGACCTTAAGACCTTCGAAGTGCTCGTCTTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769548.1
MDTRPSFYKILMDLPPKLLLPKGFTDKYGENLSERVRLRNKSGTSWNVRLEKMREEGEETDAYYFTRGWTKFCNDVDLKTFEVLVFFYAENSTFDVTVYAVTALEKEPAGFRAAANPMCRFDLKQHNYHKFHVPKDFSDACGLKEKREVRLECRGGSSARVKVNSCNGRVDFGGGWSGFLKANNFAINKTYSLEFLPAKNVIRVGPDYLLY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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