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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002847`

染色体: Chr06 坐标: 41237375-41240138 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002847`
名称	SmilChr06G002847
描述	pectinesterase 31
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41237375 - 41240138 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989592`
GeneID	`130989592`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989592`
原始查询	`SmilChr06G002847`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase 31
产物	pectinesterase 31
Arabidopsis	`AT3G29090` (PME31) pectin methylesterase 31 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822556] identity=78; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0407000` (OsPME29) - identity=73.6; qcov=0.959; evalue=2.43e-175; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989592

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769557.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057769557.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769557.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769557.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769557.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41237907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr6:41238137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B30,C15,C25
`Chr6:41239448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C77,C86
`Chr6:41239800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B30,C15,C25
`Chr6:41239864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769557.1

316 aa

158

316

Pectinesterase

PF01095 Pectinesterase 6-296 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769557.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	6	296	5e-74	249.4	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913574.1
CATGGTGAAAAGAGTAACGAAAAAAGAAAACATCTGTTACTTTTTTCTCATTTTTCCTCTTTCACGCGAATAATCACACTCGAATTTTCAAGATTATATAAAAAGGAATAAAGAATAAAATAAAATCGGCGATTGTTTACATCATCCTGAATCCTTTTCGCTGTTTATTTATCTCCAACATCGGAAACCGTGATTTCTTGGTCTCACAGTCGCAGATTCTCACTCCACTACCACTCCACATTCCTCCTCCCCTGCGCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989592
ATGGGCTCCAGAGTAATCACGGTGGCGCAGGACGGCGCCGCCGATTACCGGACCGTGCAGGAGGCCATCGACGCCGTGCCTCTGGGCAACGCGTGCCGCACCGTGATCCGCGTGGCGCCGGGCGTCTACCGCCAGCCGCTCTACGTGCCCAAGACCAAAAACCTCATCACGCTCGCCGGAATCAGCCCGGAGGCCACCGTGCTGACCTGGAACAACACCGCCACCAACATCGACCACCACCAGGCGGCGCGCGTCATCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769557.1
MGSRVITVAQDGAADYRTVQEAIDAVPLGNACRTVIRVAPGVYRQPLYVPKTKNLITLAGISPEATVLTWNNTATNIDHHQAARVIGTGTFGCGSTIVEGEDFIAENITFENCAPQGSGQAVALRVTADRCAFYNCRFLGWQDTLYLHYGKQYLRDCYVEGSVDFIFGNSTALLEHCHIHCKSAGFITAQSRKTSTETTGYIFLRCVITGNGTKEYAYLGRPWGPFGRVVYAYTYIDGCVKQVGWNNWGKVENERTACFY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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