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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002851`

染色体: Chr06 坐标: 41264298-41270611 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002851`
名称	SmilChr06G002851
描述	ARF guanine-nucleotide exchange factor GNOM-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41264298 - 41270611 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989595`
GeneID	`130989595`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989595`
原始查询	`SmilChr06G002851`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARF guanine-nucleotide exchange factor GNOM-like
产物	ARF guanine-nucleotide exchange factor GNOM-like
Arabidopsis	`AT1G13980` (GN) sec7 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837958] identity=67; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0666100` (OsGNOM1) - identity=58.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity); GO:0032012 (regulation of ARF protein signal transduction)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01369 (Sec7); PF12783 (Sec7-like_HUS); PF23325 (TPR_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989595

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769559.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057769559.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769559.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057769559.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769559.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41264868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:41264962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B47
`Chr6:41265015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr6:41265413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr6:41265460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr6:41265779`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B3
`Chr6:41265779`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B3
`Chr6:41266226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B50,C47,C7
`Chr6:41266290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr6:41266427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:41266567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr6:41266647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B101,B2,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769559.1

1440 aa

720

1440

Sec7-like_HUS

Sec7

TPR_28

PF12783 Sec7-like_HUS 298-458 aa PF01369 Sec7 544-727 aa PF23325 TPR_28 1226-1401 aa

XP_057769560.1

1440 aa

720

1440

Sec7-like_HUS

Sec7

TPR_28

PF12783 Sec7-like_HUS 298-458 aa PF01369 Sec7 544-727 aa PF23325 TPR_28 1226-1401 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769559.1`	Pfam	`PF12783`	Sec7-like_HUS	Repeat	298	458	3.2e-39	135.1	Mon2/Sec7/BIG1-like, HUS domain
`XP_057769559.1`	Pfam	`PF01369`	Sec7	Domain	544	727	3.4e-69	232.9	Sec7 domain
`XP_057769559.1`	Pfam	`PF23325`	TPR_28	Repeat	1226	1401	4.3e-46	157.6	GBF1-like, tetratrico peptide repeat region
`XP_057769560.1`	Pfam	`PF12783`	Sec7-like_HUS	Repeat	298	458	3.2e-39	135.1	Mon2/Sec7/BIG1-like, HUS domain
`XP_057769560.1`	Pfam	`PF01369`	Sec7	Domain	544	727	3.4e-69	232.9	Sec7 domain
`XP_057769560.1`	Pfam	`PF23325`	TPR_28	Repeat	1226	1401	4.3e-46	157.6	GBF1-like, tetratrico peptide repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913576.1
AAAAGAAAAAGGAAATACTACAAGAGAGCAGGCCTCTCGTGGCTAGAAGCGCAAAAAACGTAATTCTCCATTTATCTTATGGGAAACGCAGAAACGTGCTTTTCCAAATCTCGATTTCGCATTTAACCCAAATATTTTTTTATTTTTAATTCAAATTGCCACAACTGTCGCCTCCGTCACCGCAGGTAGCAGGCGACGACCCCCCCTCACCCTGCGGAGAAGCAAAAACTACCTCTTCCATCGCGTCGGCTCCGATCTTC...

XM_057913577.1
CAAATATTTTTTTATTTTTAATTCAAATTGCCACAACTGTCGCCTCCGTCACCGCAGGTAGCAGGCGACGACCCCCCCTCACCCTGCGGAGAAGCAAAAACTACCTCTTCCATCGCGTCGGCTCCGATCTTCAATCCGACCGTGCAGTACTAAATTGCGCTGCAGGGGACCTTCATGCCTGTGCTAGAAGCTTAAGTTTGCGACAGTACAGAACAAGATGACTAGTTTGCTAAATCAGGAGAATGAAGTAAATGGGTTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989595
ATGACTAGTTTGCTAAATCAGGAGAATGAAGTAAATGGGTTGGTTGAGCAACCGAATTGCTCATTCAAGCTTTCTGGTGGAGCTTTAGCATGTATGGTGAATTCAGAGATTGGTGCGGTTTTGGCTGTGATGAGAAGAAATGTGAGATGGGGAGTGCAATATGCCTCTGATGATGACCAGATAGAGCACTCTCTCATAAAGTCCTTCAAGGAACTCCGGAAAAAGATTTTTTCATGGCAAAATCATTGGCATACCATTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769559.1
MTSLLNQENEVNGLVEQPNCSFKLSGGALACMVNSEIGAVLAVMRRNVRWGVQYASDDDQIEHSLIKSFKELRKKIFSWQNHWHTIDPVLYLQPFLEVIKSDETGAPITGVALSSVYKILNLQILDSETVNVDNALHLIVDAVTSCRFEVTDPASEEVVLMKILQVLLACMKSKASVNLNNHHVCSIVNTCFRIVHQASSKSELLQRISRHTMHELVRCIFLHLPDLEGRKNQLPCGEKSSLNIEDNAAVQSPTSEGKPK...

XP_057769560.1
MTSLLNQENEVNGLVEQPNCSFKLSGGALACMVNSEIGAVLAVMRRNVRWGVQYASDDDQIEHSLIKSFKELRKKIFSWQNHWHTIDPVLYLQPFLEVIKSDETGAPITGVALSSVYKILNLQILDSETVNVDNALHLIVDAVTSCRFEVTDPASEEVVLMKILQVLLACMKSKASVNLNNHHVCSIVNTCFRIVHQASSKSELLQRISRHTMHELVRCIFLHLPDLEGRKNQLPCGEKSSLNIEDNAAVQSPTSEGKPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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