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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002862`

染色体: Chr06 坐标: 41457799-41515810 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002862`
名称	SmilChr06G002862
描述	early nodulin-like protein 17
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41457799 - 41515810 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990970`
GeneID	`130990970`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990970`
原始查询	`SmilChr06G002862`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	early nodulin-like protein 17
产物	early nodulin-like protein 17
Arabidopsis	`AT5G15350` (ENODL17) early nodulin-like protein 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831387] identity=56.2; qcov=0.945; evalue=2.06e-47; confidence=medium
Rice	`Os09g0557900` (OsENODL21) - identity=40.8; qcov=0.938; evalue=4.45e-27; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF02298 (Cu_bind_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990970

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057771160.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057771160.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057771160.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771160.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771160.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41457813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C47
`Chr6:41457818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C37
`Chr6:41457838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C53
`Chr6:41457840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C33,C46,C48
`Chr6:41457894`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	B102,B119,B123,B124,B135,B33,B53,B60,B71,B85,B94,B98,C18,C19,C42,C48,C63,C65,C72,C82
`Chr6:41457898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:41457902`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	94	A14,A20,A21,A22,A8,A9,B1,B102,B106,B108,B109,B110,B117,B119,B121,B122,B123,B124,B128,B13,B131,B133,B135,B136,B137,B139,B18,B21,B24,B26,B31,B33,B36,B37,B40,B43,B47,B48,B50,B52,B53,B56,B58,B60,B68,B69,B7,B71,B73,B74,B77,B85,B86,B88,B89,B9,B93,B94,B97,B98,C10,C11,C14,C18,C19,C22,C23,C27,C29,C3,C30,C31,C34,C38,C42,C44,C48,C5,C52,C54,C56,C60,C61,C63,C65,C67,C69,C7,C71,C72,C74,C82,C87,D4
`Chr6:41457911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B78
`Chr6:41457914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B110,B68,C14
`Chr6:41457914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B68,C14
`Chr6:41457933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B78
`Chr6:41457946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A8,B105,B115,B20,B56,B70,C3,C34,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771160.1

128 aa

128

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 39-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771160.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	39	121	6e-21	75.0	Plastocyanin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915177.1
ATGGCTCAATCCAACGCCAGGGGAGTTCTGTTGGCAGCGGCGGCGCTCCTGTTTGCGACGGTGATGTTGCCGGAGGTGGCGGCGGTGCGTTACATAGTAGGTGGCAACATGGGCTGGAGCCAAAGTGTGAACTACACAATTTGGGCTCAGGACAAGAAGTTCTACAATGGGGATTGGCTCTTTTTCGTGTACGATAGGAACCAGATGAACGTTCTTGAGGTAAACAAGACAAATTTCGAGAGCTGCAACTCCGAGCATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990970
ATGGCTCAATCCAACGCCAGGGGAGTTCTGTTGGCAGCGGCGGCGCTCCTGTTTGCGACGGTGATGTTGCCGGAGGTGGCGGCGGTGCGTTACATAGTAGGTGGCAACATGGGCTGGAGCCAAAGTGTGAACTACACAATTTGGGCTCAGGACAAGAAGTTCTACAATGGGGATTGGCTCTTTTTCGTGTACGATAGGAACCAGATGAACGTTCTTGAGGTAAACAAGACAAATTTCGAGAGCTGCAACTCCGAGCATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771160.1
MAQSNARGVLLAAAALLFATVMLPEVAAVRYIVGGNMGWSQSVNYTIWAQDKKFYNGDWLFFVYDRNQMNVLEVNKTNFESCNSEHPLHNWTTGAGRDVVPLNVTKTFYFINGKGFCFGGMKVAIHVE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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