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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G002863

染色体: Chr06 坐标: 41461069-41471689 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G002863
名称SmilChr06G002863
描述uncharacterized SmilChr06G002863
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向41461069 - 41471689 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130989607
GeneID130989607
locus_tag-
NCBI NameLOC130989607
原始查询SmilChr06G002863

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述confidence=no_hit
产物confidence=no_hit
Arabidopsis-
-
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130989607

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057769603.1
2 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057769606.1
3 Cytoplasmic granule 细胞质颗粒 0.20000 XP_057769606.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057769603.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057769603.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr6:41461233 C CT 1bp_insertion frameshift_variant 11 A2,A22,B19,B54,B55,B71,B91,C23,C27,C5,C86
Chr6:41461255 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B64,C6
Chr6:41461510 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 A20,B8,C4
Chr6:41461594 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C40
Chr6:41461720 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B53,B64,C6
Chr6:41461788 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B101,B78,C2,C32,C68
Chr6:41461895 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 A15,B81,D1
Chr6:41461941 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B65,C46,C49
Chr6:41461964 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B104,D11
Chr6:41462005 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B99,C17
Chr6:41462234 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11
Chr6:41462268 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 A2,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA
XM_057913623.1
GTGAAATAATTACGTATAGTGTAACAGTGCCCTAATTCTCCTCCCTCGCTGCACACAACTTCCGCCACCATTCTCCCCGCGCCACCCAGCCGATGTTACACCTTCCGGCGGCGGCGCCTCCATCCCGTCATCATTCTCTCGCTGATTTCTCATTATCGACATCGCTCCGCACTCGCTGATTCCTCAGATTTCGTAGGAATTTGAAGTCCCAATCGCTGAAGTCAGTTCCACAGATGAAGTTTCCATCGCTGATTCCTCAT...
XM_057913620.1
CGGGTATATCACCGCGCCTCAAGGCGGCCGATTAATTCGATTTTCACAACACTGGAGAATTTAAATTTTGTATTTGTCATCCATCTTCAAGAGTTGAGTGATAATAATCTTGTATCTGTCTTCCATCATCAAGAAGAGTTGAGTGGTGGTAATAAATACGCACTAATGGTTGAAAAGGTGTGTCAAGTTAAACAATACTTTGAAAAAGAATATGCTGAATTTAAAGGATCAACAACCAAAATGTGGTCGGACCACATTCA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA
LOC130989607
ATGGTTGAAAAGGTGTGTCAAGTTAAACAATACTTTGAAAAAGAATATGCTGAATTTAAAGGATCAACAACCAAAATGTGGTCGGACCACATTCAAATGAAATTTCGACTTATTTTCAGGGGCGTCATCCATGGTCTTATCTACCTTTATAGAATGAAGAAGATGTGTGGCAATCTGGCTAACAATATCTTTGTCTCTACCCACACTGGAAAAGGTAGGATTTTGCCTTCAATGGACCCTGCATTGGATTTCGAGCAGAA...
LOC130989607
ATGGTTGAAAAGGTGTGTCAAGTTAAACAATACTTTGAAAAAGAATATGCTGAATTTAAAGGATCAACAACCAAAATGTGGTCGGACCACATTCAAATGAAATTTCGACTTATTTTCAGGGGCGTCATCCATGGTCTTATCTACCTTTATAGAATGAAGAAGATGTGTGGCAATCTGGCTAACAATATCTTTGTCTCTACCCACACTGGAAAAGGTAGGATTTTGCCTTCAATGGACCCTGCATTGGATTTCGAGCAGAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA
XP_057769603.1
MVEKVCQVKQYFEKEYAEFKGSTTKMWSDHIQMKFRLIFRGVIHGLIYLYRMKKMCGNLANNIFVSTHTGKGRILPSMDPALDFEQKSVHMMRQNIESDVNSLVDAMTSIIAMAHEKGGHDIKNLSVDLPSELVHFFDFIRQNKLIDKMESSPKSTENLPNFMSVFIDHPYFWNIKERVLFAYRLHRVVKTNEALKLIFNSKLTNDVNAVSVSPWSSRLTGRYRKIYDWANRDGSGVKRYNSTDIARFYNAVYNHINDTM...
XP_057769604.1
MVEKVCQVKQYFEKEYAEFKGSTTKMWSDHIQMKFRLIFRGVIHGLIYLYRMKKMCGNLANNIFVSTHTGKGRILPSMDPALDFEQKSVHMMRQNIESDVNSLVDAMTSIIAMAHEKGGHDIKNLSVDLPSELVHFFDFIRQNKLLHRVVKTNEALKLIFNSKLTNDVNAVSVSPWSSRLTGRYRKIYDWANRDGSGVKRYNSTDIARFYNAVYNHINDTMHTNDPEDEYGKQVITDEQIEKDLSVIFPYYYKVMFEIYC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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