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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002872`

染色体: Chr06 坐标: 41552241-41553529 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002872`
名称	SmilChr06G002872
描述	uncharacterized SmilChr06G002872
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41552241 - 41553529 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989646`
GeneID	`130989646`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989646`
原始查询	`SmilChr06G002872`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PPR containing protein (DUF179) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822579]; symbol=AT3G29240; hit=AT3G29240; species=arabidopsis; confidence=high
产物	PPR containing protein (DUF179) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822579]; symbol=AT3G29240; hit=AT3G29240; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G29240` (AT3G29240) PPR containing protein (DUF179) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822579] identity=54.9; qcov=1.11; evalue=1.03e-100; confidence=high
Rice	`Os10g0330400` - identity=54.1; qcov=0.963; evalue=3.47e-88; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02622 (DUF179)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989646

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769665.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057769665.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769665.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769665.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769665.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41552718`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B14,B65,C46,C5
`Chr6:41552718`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B14,B65,C46,C5
`Chr6:41552736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr6:41552737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A18,B1,B103,B113,B119,B12,B120,B125,B132,B32,B34,B36,B48,B7,B74,B91,B93,C15,C42,C44,C80,D2,D6
`Chr6:41552844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C33
`Chr6:41552864`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C15
`Chr6:41552864`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C15
`Chr6:41553038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C37
`Chr6:41553109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr6:41553120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:41553149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B78,C2,C32,C68
`Chr6:41553214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769665.1

267 aa

134

267

DUF179

PF02622 DUF179 89-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769665.1`	Pfam	`PF02622`	DUF179	Domain	89	264	9.7e-30	104.1	AlgH-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913682.1
GTAAAGTGAATCTCACTCCAAATTCTAGTAAGCACAAAAGTTTCTCTTATCCATTGGTAAACTTATAAGTATGATATATCCATTTCTTGCATGCACTATATAGTGAGGTGATCATATCATATCTAGTAAGAAAAGCTTGCTTAATTTCTCTCATCATCAACAACCATGGAGCTTCTTTCTCCAATCAGAGCCAGGATTTCCACATTCAAAACGCTTGAAACTAGAAAGTTTGGTGCTCCATTTTCCGTAGCATGTTGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989646
ATGGAGCTTCTTTCTCCAATCAGAGCCAGGATTTCCACATTCAAAACGCTTGAAACTAGAAAGTTTGGTGCTCCATTTTCCGTAGCATGTTGTGCGTCAGGTCCAGCGCAAGACGAAGAAGGTCCATTTGTGAGCTCCGACTGGCGGGCCTTCCGGGCCGCACTGGTGGCCCGACAACGAGCTCCGCTCTCCTCCGCCGCCGGGCCGCCAATCACGATCGGGGACAAATGGGCCCACACCATCTACGAGCCCGAGCGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769665.1
MELLSPIRARISTFKTLETRKFGAPFSVACCASGPAQDEEGPFVSSDWRAFRAALVARQRAPLSSAAGPPITIGDKWAHTIYEPERGCLLIATEKLDGVHIFERTVILLLSTGPVGPTGLILNRPSLMSIKEMRWSAVDASGPFSEKALFFGGPLEEGLFLVSPRGGGGGGVERSGVVEKVMEGVYYGTKESAGCAAEMVKRSVVEAEEFRFFHGYCAWEGEQLRDEIRAGYWTVAACSPAVIQQTSVGGVGLWGEILGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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