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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002880`

染色体: Chr06 坐标: 41615232-41620507 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002880`
名称	SmilChr06G002880
描述	probable mitochondrial saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase At5g39410
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41615232 - 41620507 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989632`
GeneID	`130989632`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989632`
原始查询	`SmilChr06G002880`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable mitochondrial saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase At5g39410
产物	probable mitochondrial saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase At5g39410
Arabidopsis	`AT5G39410` (AT5G39410) Saccharopine dehydrogenase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833937] identity=68.2; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0597100` - identity=62.3; qcov=0.475; evalue=1.5e-95; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005811 (lipid droplet); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009247 (glycolipid biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF03435 (Sacchrp_dh_NADP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989632

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057769644.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057769644.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057769644.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057769644.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769644.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41615278`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B30,C15,C25,D11
`Chr6:41615278`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B30,C15,C25,D11
`Chr6:41615282`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A13,B135,B25,B33,B44,B56,B71,B79,B90,B92,B96,C19,C53,C6,C77,D9
`Chr6:41615283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr6:41615305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C15,C25
`Chr6:41615316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,C15,C25,D11
`Chr6:41615324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C15,C25
`Chr6:41615326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr6:41615327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:41615335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:41615374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C15,C25
`Chr6:41615400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769644.1

469 aa

234

469

Sacchrp_dh_NADP

PF03435 Sacchrp_dh_NADP 16-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769644.1`	Pfam	`PF03435`	Sacchrp_dh_NADP	Family	16	150	1.5e-09	38.9	Saccharopine dehydrogenase NADP binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913661.1
CCTTGGCCTTGCCCTGCAATCTTTGAAAATGGCGGGAATCAATACCGACGTCCGGAGCTCCAAAACCTATGACGTCGTCATCTTCGGCGCCTCCGGTTTCACCGGAAAATACGTAATCCGAGAAGCCCTCAAATTCCTCCACGCTCCCAACTCGCCCCTCAAATCCCTGGCCTTGGCGGGCCGAAGCCCGTCGCGGCTATCGGAGGCCCTCGCATGGGCCTCGGCCTCGAACCCGCCGCCCCAGATCCCCCTCCTGACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989632
ATGGCGGGAATCAATACCGACGTCCGGAGCTCCAAAACCTATGACGTCGTCATCTTCGGCGCCTCCGGTTTCACCGGAAAATACGTAATCCGAGAAGCCCTCAAATTCCTCCACGCTCCCAACTCGCCCCTCAAATCCCTGGCCTTGGCGGGCCGAAGCCCGTCGCGGCTATCGGAGGCCCTCGCATGGGCCTCGGCCTCGAACCCGCCGCCCCAGATCCCCCTCCTGACCGCCGACACTTCAGACCCGGACTCGCTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769644.1
MAGINTDVRSSKTYDVVIFGASGFTGKYVIREALKFLHAPNSPLKSLALAGRSPSRLSEALAWASASNPPPQIPLLTADTSDPDSLARLASQARIILDCVGPFRLYGQPVVAACVDSGCDYLDICGEPDFMERMEASYHDTAVENGSLVVSACGFDSVPAEIGLLFHLKHWVGPSAPSRVEAYLSLESDKRIVLNFGTYESAVLGVANADKLAELRRSRLRRARPAIPGAAPPKGFTIEKQKQLGLWALRLPSADSTVVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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