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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002883`

染色体: Chr06 坐标: 41639556-41643367 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002883`
名称	SmilChr06G002883
描述	uncharacterized SmilChr06G002883
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41639556 - 41643367 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989642`
GeneID	`130989642`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989642`
原始查询	`SmilChr06G002883`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831391]; symbol=AT5G15390; hit=AT5G15390; species=arabidopsis; confidence=high
产物	tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831391]; symbol=AT5G15390; hit=AT5G15390; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G15390` (AT5G15390) tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831391] identity=58.7; qcov=0.96; evalue=7.21e-140; confidence=high
Rice	`Os07g0598100` - identity=66; qcov=0.754; evalue=6.99e-126; confidence=high
GO	GO:0002938 (tRNA guanine ribose methylation); GO:0003723 (RNA binding); GO:0009020 (GO:0009020)
KEGG	-
Pfam	PF00588 (SpoU_methylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989642

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769656.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057769656.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769656.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769656.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769656.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41640203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:41640306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr6:41640890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:41640911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C82
`Chr6:41641534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B67,C47,C7
`Chr6:41642750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769656.1

378 aa

189

378

SpoU_methylase

PF00588 SpoU_methylase 183-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769656.1`	Pfam	`PF00588`	SpoU_methylase	Family	183	324	1.2e-34	120.1	SpoU rRNA Methylase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090705.1
GGACGGTAAAGGCCCTCCTGAGATCGAGATCAACGATCTTAATCACAGATTAGTTCAAATATCAGCGTGGATTTTAATTTTTTAAATGACATGGTATGAACCGACATCGTTTTATGCCATGTCATTTTAAAAAATAAAATATAAATTACACAGTGGCATTCGCGGCGAGCCATATCATGTTTTTGGTGATCGAAAAATGGACGCTGGATATTATTGACACGAATGTAATAGTTTGGGGTTTTAGACGATATTTATAATAG...

XR_009090704.1
CCTTACGACGACGTAATGAACTCAGTTCATCTCCCCCGTTTGCAAATGAACTCCTGCAAAACCCTAATTCGCGCTACATTATCATGCCTGGATTTCCGAGCTCGAATTCCAAATTCAAGTATGCTGCGCCATTTTCCCGTCTCTCTTTCATCTCGTCCAGGGTTGAGAATCAAATCCCACAAGCCCTTTTCGATTTCTAGAAGCTTCGGTAGTCTGGCAACCGCTATTACATCAGAAATTTCCGATTGTACAGAGGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989642
ATGAACTCAGTTCATCTCCCCCGTTTGCAAATGAACTCCTGCAAAACCCTAATTCGCGCTACATTATCATGCCTGGATTTCCGAGCTCGAATTCCAAATTCAAGTATGCTGCGCCATTTTCCCGTCTCTCTTTCATCTCGTCCAGGGTTGAGAATCAAATCCCACAAGCCCTTTTCGATTTCTAGAAGCTTCGGTAGTCTGGCAACCGCTATTACATCAGAAATTTCCGATTGTACAGAGGGAATTGTAGCTCATAGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769656.1
MNSVHLPRLQMNSCKTLIRATLSCLDFRARIPNSSMLRHFPVSLSSRPGLRIKSHKPFSISRSFGSLATAITSEISDCTEGIVAHSVNLETLQDLCKDRVEELLSSKNKDDVSSLMKMERRLGNGDESNGAERRKRWFPYLDKCTAEDAYLSSSEVLEAVAPYIMDPRKEKFRNAVNNRSYSVCLVVEGLSDFGNVSAAFRSADALGIQSVHVVSFDSSKRYRDNRHVSMGAEKWLDIELWDSISECFEVLKARGYRIAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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