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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002886`

染色体: Chr06 坐标: 41680448-41685099 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002886`
名称	SmilChr06G002886
描述	cyclic nucleotide-gated ion channel 2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41680448 - 41685099 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989622`
GeneID	`130989622`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989622`
原始查询	`SmilChr06G002886`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclic nucleotide-gated ion channel 2
产物	cyclic nucleotide-gated ion channel 2
Arabidopsis	`AT5G15410` (DND1) Cyclic nucleotide-regulated ion channel family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831393] identity=69.4; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0758300` (OsCNGC7) - identity=64.8; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00027 (cNMP_binding); PF00520 (Ion_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989622

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769629.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769629.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769629.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769629.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769629.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41680763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:41680905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:41681027`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C36
`Chr6:41681027`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C36
`Chr6:41681090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B60,D3
`Chr6:41681533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B78,C23
`Chr6:41681869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C84
`Chr6:41681897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B17,B95,B99,C18
`Chr6:41682204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:41682210`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B11
`Chr6:41682210`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B11
`Chr6:41684216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769629.1

673 aa

336

673

cNMP_binding

PF00027 cNMP_binding 512-598 aa

XP_057769630.1

669 aa

334

669

Ion_trans

cNMP_binding

PF00520 Ion_trans 149-404 aa PF00027 cNMP_binding 508-594 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769629.1`	Pfam	`PF00027`	cNMP_binding	Domain	512	598	1e-06	29.3	Cyclic nucleotide-binding domain
`XP_057769630.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	149	404	6.5e-06	26.2	Ion transport protein
`XP_057769630.1`	Pfam	`PF00027`	cNMP_binding	Domain	508	594	1e-06	29.3	Cyclic nucleotide-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913646.1
TTCGTCCTTTTCCCTTGATGCGCTGGCCGCTGCATAATCTCACTCCCTCCCTCTTTACTTCACTTATCAGAAAATCCAACGTATTTATACCCCCATTTTCATTTCCCCTTTCCCCACATCTTCTCACCTCTCCTCCTCCTCCCATGGTTTCCCTCACCCTTCCAACATGCCTCTTTCCCACAATCCAACCTCACCAAGGTGGTTTGGAATATTCCGGCGAGGATCGCTGGACGACGGCGCCGCCGAAGACCACCAGATCC...

XM_057913647.1
TCCTTTTCCCTTGATGCGCTGGCCGCTGCATAATCTCACTCCCTCCCTCTTTACTTCACTTATCAGAAAATCCAACGTATTTATACCCCCATTTTCATTTCCCCTTTCCCCACATCTTCTCACCTCTCCTCCTCCTCCCATGGTTTCCCTCACCCTTCCAACATGCCTCTTTCCCACAATCCAACCTCACCAAGGTGGTTTGGAATATTCCGGCGAGGATCGCTGGACGACGGCGCCGCCGAAGACCACCAGATCCTCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989622
ATGCCTCTTTCCCACAATCCAACCTCACCAAGGTGGTTTGGAATATTCCGGCGAGGATCGCTGGACGACGGCGCCGCCGAAGACCACCAGATCCTCTCCGTCGGCGGCGAGTGCTACGCATGCACGCAGGTCGGGGTTCCGGTCTTCCACTCCACCAGCTGCGACGGCGCCAACCAGCCGGAGTGGGAGGCCTCCGCCGGCTCCTCGCTGCTCCCCATAAGGGACCGGGCCGGCGCCCAGAAGCACGGCGGCGGACCGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769629.1
MPLSHNPTSPRWFGIFRRGSLDDGAAEDHQILSVGGECYACTQVGVPVFHSTSCDGANQPEWEASAGSSLLPIRDRAGAQKHGGGPEPRSARRLWSVLDPRSKRVQRWNRAFLLARGMALAVDPLFFYALSIGRGGSPCLYLDGGLAAAVTVLRTCVDAVHLCHLLLQFRIAYVSRESLVVGCGKLVWDARAVAAHYLRSLRGFWFDVFVILPVPQLLVQAVFWFVVPRLIKENKICSIMTIMLLMFLFQFLPKVYHSIS...

XP_057769630.1
MPLSHNPTSPRWFGIFRRGSLDDGAAEDHQILSVGGECYACTQVGVPVFHSTSCDGANQPEWEASAGSSLLPIRDRAGAQKHGGGPEPRSARRLWSVLDPRSKRVQRWNRAFLLARGMALAVDPLFFYALSIGRGGSPCLYLDGGLAAAVTVLRTCVDAVHLCHLLLQFRIAYVSRESLVVGCGKLVWDARAVAAHYLRSLRGFWFDVFVILPVPQAVFWFVVPRLIKENKICSIMTIMLLMFLFQFLPKVYHSISLMRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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