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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002906`

染色体: Chr06 坐标: 41858253-41862279 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002906`
名称	SmilChr06G002906
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 59 kDa protein-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41858253 - 41862279 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989639`
GeneID	`130989639`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989639`
原始查询	`SmilChr06G002906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 59 kDa protein-like
产物	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 59 kDa protein-like
Arabidopsis	`AT2G46200` (AT2G46200) U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819227] identity=50.6; qcov=0.998; evalue=7.81e-132; confidence=high
Rice	`Os01g0226500` (P0492F05.33-1) - identity=53; qcov=0.966; evalue=1.87e-123; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF16021 (PDCD7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989639

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769653.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057769653.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057769653.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769653.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769653.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41859292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:41859314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B4,D6
`Chr6:41859626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:41859683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr6:41859737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C56
`Chr6:41860203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B61,B68,C36,C5
`Chr6:41860209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B47,D1
`Chr6:41860523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr6:41860576`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C36,C8
`Chr6:41860576`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C36,C8
`Chr6:41861200`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B81
`Chr6:41861200`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769653.1

414 aa

207

414

PDCD7

PF16021 PDCD7 345-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769653.1`	Pfam	`PF16021`	PDCD7	Family	345	410	2.8e-19	70.2	Programmed cell death protein 7

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913670.1
AAGAAGATGAAACTATATAGATGGGGGTTTCAAGTGATGTGAGCGGAATGTGAGCTGTGTGACTCTCGAAAATCAATGTAAATCGGAGCTGATATAAGACGGATCCATTTAGTTTTACTAGAGGTAAAATTGAACTGAACACTATGAATCCAATGGGGATGCCTCCATTTAACCAGGCCCTACCGCCGTGGGGCCCGCCACCGCCGCCGCAGCTGCCGCATATGCCCCCTCCGTCTGCTTCGTTCTGGACTTCGGCAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989639
ATGAATCCAATGGGGATGCCTCCATTTAACCAGGCCCTACCGCCGTGGGGCCCGCCACCGCCGCCGCAGCTGCCGCATATGCCCCCTCCGTCTGCTTCGTTCTGGACTTCGGCAAACGTCAGCAGCCGCCTCAAAGAACTTCACGACACTTTAAACCTCGCCAAAGCAATGCAGAAAGAGTTGGAGATGTTGATTCGTTTGAAAGAAATGGATGGGATTAGCGAAGGTGAAGATTTAGGGCGTGGCAACATGTCGATTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769653.1
MNPMGMPPFNQALPPWGPPPPPQLPHMPPPSASFWTSANVSSRLKELHDTLNLAKAMQKELEMLIRLKEMDGISEGEDLGRGNMSISRFSRFMKDNGIGVEFQETMSLSTANAVMSKLRFLLEPFRVVADENSPWEEKSAVKRLADKMEKYKRNKLWRKKKRRRVAENIAKEHEQFDKIDKEADEWRKREIAKDIAQQKVEKMKEIAKLKAKEEKKRLESELELVLIVEKLQELRSLRIQKMKKQGHFLPEEDDKFLERV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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