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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002909`

染色体: Chr06 坐标: 41897025-41906844 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002909`
名称	SmilChr06G002909
描述	uncharacterized SmilChr06G002909
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41897025 - 41906844 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989623`
GeneID	`130989623`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989623`
原始查询	`SmilChr06G002909`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0577100; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0577100; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G00830` (LIF2) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827998] identity=37.1; qcov=0.407; evalue=1.2e-43; confidence=low
Rice	`Os12g0577100` - identity=38.5; qcov=0.725; evalue=2.63e-61; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF18360 (hnRNP_Q_AcD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989623

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769631.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	0.40000	`XP_057769631.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057769631.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769631.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769631.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41897175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B47,D1
`Chr6:41897304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B28,D5
`Chr6:41897366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr6:41897392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B23,B58
`Chr6:41897929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B28,D5
`Chr6:41905127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,D3
`Chr6:41906266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769631.1

610 aa

305

610

RRM_1

hnRNP_Q_AcD

PF00076 RRM_1 19-87 aa PF00076 RRM_1 98-161 aa PF00076 RRM_1 198-259 aa PF18360 hnRNP_Q_AcD 326-391 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769631.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	19	87	4.2e-47	158.6	RNA recognition motif
`XP_057769631.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	98	161	4.2e-47	158.6	RNA recognition motif
`XP_057769631.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	198	259	4.2e-47	158.6	RNA recognition motif
`XP_057769631.1`	Pfam	`PF18360`	hnRNP_Q_AcD	Domain	326	391	2.5e-12	47.5	Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q acidic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913648.1
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACACCTATCATCATTCTTCTTGAACCCTAATTTCCCCTTCTCACTCGTCTGCATCTTCAATTCCAGATTTTGCATATTCAATTCCGGAGTTTGGGGACACAACAGCAGATTCAAGAAATGATGAGCCAGCCGTTGGAGCAACACTCTGCTGATCATGCAAAAGGCGTCGAGGTTTTTGTTGGTGGGTTGCCTCGGACCATTGATGAAGAGAAAATTCGCGAGGTGTTTTCCGATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989623
ATGATGAGCCAGCCGTTGGAGCAACACTCTGCTGATCATGCAAAAGGCGTCGAGGTTTTTGTTGGTGGGTTGCCTCGGACCATTGATGAAGAGAAAATTCGCGAGGTGTTTTCCGATTGCGGTGATATAGTGGAAGTTCGTATGATAAAGGACCAGAACGGCAATACAAAGGGATTCTGCTTTGTGAGATTTTCGACGAAAGAATCTGCAGCGAGAGCTGTGAGGGAAAAAACTGGAATTTTGCTAGATGGGAAGAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769631.1
MMSQPLEQHSADHAKGVEVFVGGLPRTIDEEKIREVFSDCGDIVEVRMIKDQNGNTKGFCFVRFSTKESAARAVREKTGILLDGKKIGVLPSSEQETLYFGNLNKAWTADEFKRMVLQIFPDIESIDLAMIKDTPPGQKPRNRGFAFVKFSSHAAAARALRVGSQPEFRLGSLHPAIQWAEEDSEIDAKELAKVKVAFVRNLPTDAEEKYLSRLFDPYGKVERVVVSKKGSSSVGFVHFTERSDLERAVNELNGKKVGGP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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