Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002911`

染色体: Chr06 坐标: 41946980-41960198 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002911`
名称	SmilChr06G002911
描述	uncharacterized SmilChr06G002911
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41946980 - 41960198 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990972`
GeneID	`130990972`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990972`
原始查询	`SmilChr06G002911`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990972

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771163.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057771163.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771163.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057771163.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41947126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr6:41947215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr6:41947219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,D5
`Chr6:41947237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B140,B17
`Chr6:41959371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr6:41959375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,A22,C41
`Chr6:41959391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B54,B84,B9,C9
`Chr6:41959395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A13,A20,A24,A5,B10,B139,B27,B34,B35,B39,B51,B54,B70,B76,B79,B9,C13,C19,C37,C49,C59,C70,C77,C83,C9,D9
`Chr6:41959419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr6:41959431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B22,B89,C40,C75
`Chr6:41959431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B89,C40,C75
`Chr6:41959687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	79	A13,A15,A19,A2,A22,A3,A4,A5,A8,B100,B104,B106,B107,B110,B113,B120,B123,B130,B131,B132,B136,B139,B15,B16,B18,B19,B23,B24,B28,B32,B33,B46,B50,B52,B58,B60,B61,B64,B66,B67,B77,B79,B8,B80,B82,B84,B85,B88,B91,B94,C1,C10,C13,C16,C21,C27,C29,C33,C35,C36,C38,C39,C40,C41,C47,C48,C52,C53,C55,C60,C63,C65,C7,C80,C85,D3,D4,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915180.1
ATGAAACAATTAGAAGAAGTCTTGCGTCAAGCACGCGAACTTATTGATAAGGGCAAAGCCCTGGCATGCACTGACAACGATGAAGGTGAGATCTTGCGCCAGGCACTCAAGACTGCTGAAAAGGGGAAAGCTCCAGCCCACGATGACACTGGGGGAAGTAGGAAGAAAACTCCAGGCAAGGCGAGTTGGAAGCCACTACCTGCTCAGCCTCTTTCCCTTAAGAAGGGTGCTACGACCTCCGATGCAGGAACGCCCTGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080392.1_cds_XP_057771163.1_33779
ATGAAACAATTAGAAGAAGTCTTGCGTCAAGCACGCGAACTTATTGATAAGGGCAAAGCCCTGGCATGCACTGACAACGATGAAGGTGAGATCTTGCGCCAGGCACTCAAGACTGCTGAAAAGGGGAAAGCTCCAGCCCACGATGACACTGGGGGAAGTAGGAAGAAAACTCCAGGCAAGGCGAGTTGGAAGCCACTACCTGCTCAGCCTCTTTCCCTTAAGAAGGGTGCTACGACCTCCGATGCAGGAACGCCCTGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771163.1
MKQLEEVLRQARELIDKGKALACTDNDEGEILRQALKTAEKGKAPAHDDTGGSRKKTPGKASWKPLPAQPLSLKKGATTSDAGTPCKDVMEPPQPPPRFPALRDMIDQMRHTRDLEDRLRRWVSHGLTAPLPAIAPVEIPPPQYHLYPPNQPANAAAHFPPYPMDGDEYENSPPRGPVVDALAPPLVPPPQEPADEPEVPRRYRIRLEDYGQPFALPEKDMMGPEIMLEDPPIPPALPAPADNDIPIIDVEEEEDPEEDP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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