当前解析结果
SmilChr06G002923| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002923 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002923 |
| 描述 | PRA1 family protein B1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 42088723 - 42089301 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990974 |
|---|---|
| GeneID | 130990974 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990974 |
| 原始查询 | SmilChr06G002923 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | PRA1 family protein B1-like |
| 产物 | PRA1 family protein B1-like |
| Arabidopsis | AT2G38360 (PRA1.B4)prenylated RAB acceptor 1.B4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818416] identity=65.2; qcov=0.368; evalue=2.56e-11; confidence=low |
| Rice | Os04g0589700 (OsPUB35)- identity=40.3; qcov=0.536; evalue=5.59e-09; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990974 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057771165.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057771165.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057771165.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057771165.1 |
| 5 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057771165.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:42088787 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B24,B26 |
Chr6:42089295 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B2,C63,C67 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。