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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002927`

染色体: Chr06 坐标: 42144414-42149142 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002927`
名称	SmilChr06G002927
描述	4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42144414 - 42149142 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989668`
GeneID	`130989668`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989668`
原始查询	`SmilChr06G002927`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like
产物	4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like
Arabidopsis	`AT1G06570` (PDS1) 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837168] identity=73.7; qcov=0.852; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0168100` (OsHPPD) - identity=71.1; qcov=0.497; evalue=1.62e-114; confidence=medium
GO	GO:0003868 (4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase activity); GO:0006572 (L-tyrosine catabolic process)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00350 (Tyrosine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00360 (Phenylalanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989668

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769694.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057769694.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057769694.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769694.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42146382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B140,B56,B96
`Chr6:42146388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr6:42146392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr6:42146397`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr6:42146397`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr6:42146400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B130,B53
`Chr6:42146426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B17,C28,C71
`Chr6:42146433`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:42146451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B67,B79
`Chr6:42147953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr6:42147986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B19,C35,C48
`Chr6:42148150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913711.1
AACCCATTAACATAAAAATATTTGTGGCTATCAGCTGCATTCATATGACAAGTATACGTCTCTCTCTCTCCTCATTTCTCTCTCTAAAAGCTCCACCTCTCCGCCGCCGCCACCACCACCGCAGACTCACTCTCACTCTAAAACTCGAAGCATCTAGCTCCTCCACCCAAACAATGGGCCAAGAATCTGCCGCCACCATCGCCGTGGAGCCCGCTGTGGTGCACGGCCGATTCAAGCCGGCGGCGCGCAAGAATTTGGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989668
ATGACAAGTATACGTCTCTCTCTCTCCTCATTTCTCTCTCTAAAAGCTCCACCTCTCCGCCGCCGCCACCACCACCGCAGACTCACTCTCACTCTAAAACTCGAAGCATCTAGCTCCTCCACCCAAACAATGGGCCAAGAATCTGCCGCCACCATCGCCGTGGAGCCCGCTGTGGTGCACGGCCGATTCAAGCCGGCGGCGCGCAAGAATTTGGTCGTCCGGGCCAACCCCAGGTCCGACCACTTCCCCGTCCACCGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769694.1
MTSIRLSLSSFLSLKAPPLRRRHHHRRLTLTLKLEASSSSTQTMGQESAATIAVEPAVVHGRFKPAARKNLVVRANPRSDHFPVHRFHHVEFWCGDATNAARRFSWGLGMPLAAKSDLSTGNSAHASYLLRSGELSFLFTAPYSPSIADPSSASIPTFAPSAHLAFTSSHGLAVRAVAIQVDSASSAYAASVARGAIPVSPPALLSDGKTSIAEVHLYGDSVLRYISTAGGANEWLLPGFEPVLNDQELDYGIRRLDHAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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