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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002940`

染色体: Chr06 坐标: 42219888-42222548 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002940`
名称	SmilChr06G002940
描述	ninja-family protein AFP3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42219888 - 42222548 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989680`
GeneID	`130989680`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989680`
原始查询	`SmilChr06G002940`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ninja-family protein AFP3-like
产物	ninja-family protein AFP3-like
Arabidopsis	`AT3G29575` (AFP3) ABI five binding protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822619] identity=51; qcov=0.885; evalue=7.14e-64; confidence=high
Rice	`Os07g0602900` - identity=36; qcov=1.04; evalue=1.65e-40; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0007165 (signal transduction); GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF07897 (EAR); PF16135 (TDBD); PF16136 (NLS_NINJA_AFP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989680

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769712.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769712.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769712.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769712.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769712.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42220213`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B31
`Chr6:42220213`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B31
`Chr6:42220221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B47,C8
`Chr6:42220350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr6:42221663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B55,C23,C54
`Chr6:42221720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr6:42221731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:42221944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr6:42221947`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	48	A20,B1,B102,B108,B115,B123,B128,B131,B136,B15,B25,B30,B4,B41,B44,B51,B59,B65,B73,B78,B80,B90,B92,C13,C14,C15,C18,C19,C24,C25,C27,C31,C36,C4,C49,C57,C59,C61,C70,C73,C79,C8,C82,C83,D10,D11,D7,D9
`Chr6:42221949`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	48	A20,B1,B102,B108,B115,B123,B128,B131,B136,B15,B25,B30,B4,B41,B44,B51,B59,B65,B73,B78,B80,B90,B92,C13,C14,C15,C18,C19,C24,C25,C27,C31,C36,C4,C49,C57,C59,C61,C70,C73,C79,C8,C82,C83,D10,D11,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769712.1

286 aa

143

286

EAR

NLS_NINJA_AFP

TDBD

PF07897 EAR 43-77 aa PF16136 NLS_NINJA_AFP 91-124 aa PF16135 TDBD 247-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769712.1`	Pfam	`PF07897`	EAR	Family	43	77	7.8e-17	61.3	Ethylene-responsive binding factor-associated repression
`XP_057769712.1`	Pfam	`PF16136`	NLS_NINJA_AFP	Motif	91	124	1.1e-09	38.5	Putative nuclear localisation signal in Ninja/AFP proteins
`XP_057769712.1`	Pfam	`PF16135`	TDBD	Domain	247	279	7.9e-07	29.7	Tify domain binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913729.1
TTTCTTTTCTTAAAAAATGGATTTTCTTTTGGAGTTGGATTTGCATATATATTTATATATAGGTATAAAGGTCGCAACTAGCAAGCGTGTGAAATAGGGAGACAGACAGCAAGGAAGATATTGAAAAAAACAGTAGTTGGAGAAACTTGTTAATAAATCCATTAAAAAAAATTAATTCCTCATTTATGCCACGTGGCCCTGACCAAATCCTCCTCCTCTCGGCACGTGTCACGCTCCCGACCTTCTTACGTTGCTCCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989680
ATGGAGAGTGGTGAGGGGAAACGGGAGAGGCTGAGCCTCTCGATGGGAATGAAGGGAATTTCGAGCGATCCGCTGCAGAAACTGATGAAAGAAGATGGGAAGGAGCGAGAAGCAGAGGAGGAGGAAGAAGATGAGGAAGAATTGGAGCTGAGCTTGGGGCTTTCGTTGAACGGCAGATTCGGAGTTGACCCAATGAGGAAGAGGCTGAAGCGGTCGTCCTCGATTTCGAACTTTGTTTTCGCGGTTGACAATGGCGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769712.1
MESGEGKRERLSLSMGMKGISSDPLQKLMKEDGKEREAEEEEEDEEELELSLGLSLNGRFGVDPMRKRLKRSSSISNFVFAVDNGGGEAELARTRSLPAEEWRRRKEFQSMRRMAARKKRMEKLRNVRVQHKEKECCNEGVSNGYEISSSQGSIGSTGSGSSGISDLDFEGGSQKADVPPPTIRPPQDQSEGRAAADRDAKLPPPPPSKSLKNVMCEMPYVSTKGDGPEGHKIEGFLYRYKKGEEVRIVCVCHGMFLTPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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