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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002948`

染色体: Chr06 坐标: 42278566-42282448 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002948`
名称	SmilChr06G002948
描述	protein LONGIFOLIA 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42278566 - 42282448 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989686`
GeneID	`130989686`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989686`
原始查询	`SmilChr06G002948`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LONGIFOLIA 1-like
产物	protein LONGIFOLIA 1-like
Arabidopsis	`AT1G74160` (TRM4) LONGIFOLIA protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843756] identity=31.2; qcov=1.17; evalue=7.19e-83; confidence=low
Rice	`Os07g0109400` (OJ1567_G09.117) - identity=27.4; qcov=1.05; evalue=2.37e-55; confidence=low
GO	GO:0051513 (regulation of monopolar cell growth)
KEGG	-
Pfam	PF14309 (DUF4378); PF14383 (VARLMGL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989686

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057769729.1`
2	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769729.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057769729.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769729.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42278689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:42278846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B131,D8
`Chr6:42278894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B131,D8
`Chr6:42278920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B13,B31,C18,C9
`Chr6:42278977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:42279048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C30
`Chr6:42279129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B60
`Chr6:42279165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:42279212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:42279297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,C26,C40,C41,C74
`Chr6:42279346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr6:42279597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769729.1

889 aa

444

889

VARLMGL

DUF4378

PF14383 VARLMGL 251-273 aa PF14309 DUF4378 710-865 aa

XP_057769730.1

889 aa

444

889

VARLMGL

DUF4378

PF14383 VARLMGL 251-273 aa PF14309 DUF4378 710-865 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769729.1`	Pfam	`PF14383`	VARLMGL	Domain	251	273	1.9e-06	28.0	DUF761-associated sequence motif
`XP_057769729.1`	Pfam	`PF14309`	DUF4378	Domain	710	865	1.5e-28	100.9	LONGIFOLIA 1/2-like C-terminal domain
`XP_057769730.1`	Pfam	`PF14383`	VARLMGL	Domain	251	273	1.9e-06	28.0	DUF761-associated sequence motif
`XP_057769730.1`	Pfam	`PF14309`	DUF4378	Domain	710	865	1.5e-28	100.9	LONGIFOLIA 1/2-like C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913747.1
CCCTCTACACACTACAGCCTCTAAATCCAGCAGCCTTTTTTTGAGACCCAAAACTTATATATGTCCTTATTCTTCTCTGTGGAAAAAACCCAAGAGCAATAACAGCATCTTCTCTCTTGATTTATATTCTTTTTTCCATTGAATTTGCTTTTGATACATTGAAGGAGAGAAATTGGGTTCTCTTTTTCAACACAGGAAATTGTCTGCCTTGACCACTGGAATCTTAAAAAGTGATCATTTTAGACCAGTGATCCTCAGTC...

XM_057913746.1
CCCTCTACACACTACAGCCTCTAAATCCAGCAGCCTTTTTTTGAGACCCAAAACTTATATATGTCCTTATTCTTCTCTGTGGAAAAAACCCAAGAGCAATAACAGCATCTTCTCTCTTGATTTATATTCTTTTTTCCATTGAATTTGCTTTTGATACATTGAAGGAGAGAAATTGGGTTCTCTTTTTCAACACAGGAAATTGTCTGCCTTGACCACTGGAATCTTAAAAAGTGATCATTTTAGACCAGTGATCCTCAGTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989686
ATGTCGTCTCTACGCGACGAAAGCCGAGATCTTCGGAAGCAGATGGGATGCATGAACGGATTTTTTCAAATATTCGACCGTCACCATTTCATCACGGGCAGGCGTATCAGCAGCTGCAGCAGCAAAAGGCTGCTTCAAGGTGGGCAGCACCAAATGGAGCAGCAATATGCAATGGAAAAGGGTGTGGAGATGCAGAAAGAGAAGCCAAGAATCTCGAGTGAATCATCCCGAGCCTCATTTTCATCATCTTCATGCTCATC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769729.1
MSSLRDESRDLRKQMGCMNGFFQIFDRHHFITGRRISSCSSKRLLQGGQHQMEQQYAMEKGVEMQKEKPRISSESSRASFSSSSCSSTFSSLDFNRAIQPETLSLRQISIPAATTTSSRSQHDLRDVVKESMHREVRSLCIKSHSNDERRGTVMKHIDSPRPPKAIIGPAGGAAPPRAPAKDDRLALLPRFSYDGRESREVYKSAMKHKELPRLSLDSKTNSMKAFESRLNFLGSVENEKSSQPLRSSREHGSHQRTSSV...

XP_057769730.1
MSSLRDESRDLRKQMGCMNGFFQIFDRHHFITGRRISSCSSKRLLQGGQHQMEQQYAMEKGVEMQKEKPRISSESSRASFSSSSCSSTFSSLDFNRAIQPETLSLRQISIPAATTTSSRSQHDLRDVVKESMHREVRSLCIKSHSNDERRGTVMKHIDSPRPPKAIIGPAGGAAPPRAPAKDDRLALLPRFSYDGRESREVYKSAMKHKELPRLSLDSKTNSMKAFESRLNFLGSVENEKSSQPLRSSREHGSHQRTSSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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