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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002961`

染色体: Chr06 坐标: 42396002-42396850 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002961`
名称	SmilChr06G002961
描述	la-related protein 1B-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42396002 - 42396850 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989700`
GeneID	`130989700`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989700`
原始查询	`SmilChr06G002961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	la-related protein 1B-like
产物	la-related protein 1B-like
Arabidopsis	`AT5G66100` (LARP1b) winged-helix DNA-binding transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836742] identity=39.7; qcov=0.859; evalue=1.32e-14; confidence=low
Rice	`Os03g0859300` - identity=46.7; qcov=0.706; evalue=1.4e-15; confidence=low
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF05383 (La)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769751.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057769751.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769751.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769751.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769751.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42396296`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B30,B65,C15,C25,C4,C49
`Chr6:42396319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:42396340`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B139,C56
`Chr6:42396340`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B139,C56
`Chr6:42396676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B63,C16,C35,C9
`Chr6:42396678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B13
`Chr6:42396678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:42396695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769751.1

85 aa

PF05383 La 3-34 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769751.1`	Pfam	`PF05383`	La	Domain	3	34	1.4e-09	38.4	La domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913768.1
TCAAACAAATTGAATATTATTTTTGGTTCGATTTAATTCATTTGTACTTTTTATATATATTCCTTTTTTCTTTTAACTAAGATACTAATTAAAAATAATTTTTGGTGTTGCAGTGACAACAATCTTGCCAAAGATCTTCATCTGAAAGACCAAATGGACATCGACAACGGATGGGTTTCGATTGAGGTTATTGCCGGTTTTAATCGAATAAAAGAGATGACAGATGATATTAAGTTGATTCTGGACAGCTTGAAACATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989700
ATGGACATCGACAACGGATGGGTTTCGATTGAGGTTATTGCCGGTTTTAATCGAATAAAAGAGATGACAGATGATATTAAGTTGATTCTGGACAGCTTGAAACATTCAGATACAATTGAAGTCGAGGGAGACAAACTAAGGCGACGTACTACTTGGAAGAAATGGATAGCTTATCGTAAAGTAGCGCCTTATGGAATAAAGGTTGTTCGATCGAATTCCCACCAGTTAAGGAATGTCAAGCAAAGACAAAGGAATTAA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769751.1
MDIDNGWVSIEVIAGFNRIKEMTDDIKLILDSLKHSDTIEVEGDKLRRRTTWKKWIAYRKVAPYGIKVVRSNSHQLRNVKQRQRN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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