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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002963`

染色体: Chr06 坐标: 42405206-42408792 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002963`
名称	SmilChr06G002963
描述	putative receptor-like protein kinase At5g39000
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42405206 - 42408792 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990980`
GeneID	`130990980`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990980`
原始查询	`SmilChr06G002963`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative receptor-like protein kinase At5g39000
产物	putative receptor-like protein kinase At5g39000
Arabidopsis	`AT5G39000` (AT5G39000) Malectin/receptor-like protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833892] identity=59.1; qcov=0.787; evalue=4.33e-65; confidence=high
Rice	`Os01g0769700` (DRUS2) - identity=61.5; qcov=0.735; evalue=5.51e-65; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF01636 (APH); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990980

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771172.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057771172.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057771172.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771172.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771172.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42406062`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A21,A3,A7,B1,B120,B13,B131,B136,B140,B24,B26,B28,B43,B70,B79,C13,C14,C48,C53,C60,C62,C71,C72,C8,C82,D5
`Chr6:42406120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B140
`Chr6:42406120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:42406124`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A21,B117,B13,B28,C62,C80,C82,C87,D5
`Chr6:42406128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B69,C28,C39,C61
`Chr6:42406219`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	122	A1,A10,A11,A18,A2,A20,A21,A25,A4,A7,A9,B10,B100,B101,B106,B110,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B123,B126,B127,B13,B132,B133,B137,B139,B140,B19,B2,B20,B22,B23,B25,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B34,B35,B37,B42,B43,B46,B47,B49,B50,B52,B55,B57,B58,B60,B61,B65,B66,B69,B7,B70,B75,B77,B79,B80,B81,B82,B86,B87,B91,B93,B98,B99,C13,C14,C16,C18,C20,C22,C26,C27,C31,C33,C34,C37,C41,C42,C48,C49,C51,C52,C54,C56,C57,C6,C60,C65,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C78,C80,C82,C83,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr6:42406234`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A10,A11,A16,B10,B106,B113,B119,B12,B122,B27,B38,B39,B40,B44,B57,B90,B92,B93,B95,C12,C24,C36,C42,C55,C8,C86
`Chr6:42406237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:42406257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,D10
`Chr6:42406262`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	118	A10,A11,A15,A16,A2,A22,A23,A6,A8,B10,B100,B104,B106,B108,B112,B113,B119,B12,B122,B124,B128,B134,B135,B14,B140,B15,B16,B18,B19,B24,B25,B26,B27,B30,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B44,B45,B47,B49,B51,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B63,B64,B72,B76,B79,B8,B84,B86,B9,B90,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C15,C19,C23,C24,C25,C26,C27,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C46,C5,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C61,C64,C66,C69,C71,C73,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C84,C85,C86,D2,D3,D4,D7,D8,D9
`Chr6:42406275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B98
`Chr6:42406330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771172.1

230 aa

115

230

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

APH

PF00069 Pkinase 52-199 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 52-199 aa PF01636 APH 169-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771172.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	52	199	2.8e-31	109.6	Protein kinase domain
`XP_057771172.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	52	199	4.2e-34	118.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057771172.1`	Pfam	`PF01636`	APH	Domain	169	220	4.3e-05	24.1	Phosphotransferase enzyme family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915189.1
ATGGCTACCTTAAATATACAGAATGCCCAAAAAAAAATTCTCGGGGGCGTACAATTTCAGCCCCCGAACTTAGTTCCTGGCTCCGTCCCTGATTGTCGCCGCTTTTCACTAGCTGAGTTCCAATTAGCCACTAGAAACTTCAATGGTGGACTTGTAATTGGAAGGGGTGGATTTGGTAAAGTCTACAAAGGCCTCATTGATAATGGACAAACAACTGTTGCTGTAAAGAGGTTAAAGTTGAGCTCCAGGCAGGGGGCGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990980
ATGGCTACCTTAAATATACAGAATGCCCAAAAAAAAATTCTCGGGGGCGTACAATTTCAGCCCCCGAACTTAGTTCCTGGCTCCGTCCCTGATTGTCGCCGCTTTTCACTAGCTGAGTTCCAATTAGCCACTAGAAACTTCAATGGTGGACTTGTAATTGGAAGGGGTGGATTTGGTAAAGTCTACAAAGGCCTCATTGATAATGGACAAACAACTGTTGCTGTAAAGAGGTTAAAGTTGAGCTCCAGGCAGGGGGCGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771172.1
MATLNIQNAQKKILGGVQFQPPNLVPGSVPDCRRFSLAEFQLATRNFNGGLVIGRGGFGKVYKGLIDNGQTTVAVKRLKLSSRQGAHEFLTEIETLSQLRHINLVSLFGYCSELREMILAYEHMVCGTLADHLYKLGRYNSNHSSLIWKQRLNICVGAARGLDYLHTGHRVIHRDIKASNILLDENFVAKVSDFGLAKPEDRLFELWSLLCSSKKQQDRERGMAAGDGDV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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