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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002983`

染色体: Chr06 坐标: 42629989-42633951 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002983`
名称	SmilChr06G002983
描述	receptor-like protein kinase FERONIA
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42629989 - 42633951 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989717`
GeneID	`130989717`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989717`
原始查询	`SmilChr06G002983`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein kinase FERONIA
产物	receptor-like protein kinase FERONIA
Arabidopsis	`AT3G51550` (FER) Malectin/receptor-like protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824318] identity=43.4; qcov=0.684; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os03g0333200` (DRUS1) - identity=40.7; qcov=0.705; evalue=1.16e-180; confidence=medium
GO	GO:0004714 (transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0046777 (protein autophosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF11721 (Malectin); PF12819 (Malectin_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989717

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769773.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769773.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769773.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769773.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769773.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42630156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B126,B21,C32,C37
`Chr6:42630209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:42630215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B97,C53,C60
`Chr6:42630229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B97,C53,C60
`Chr6:42630251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,B67
`Chr6:42630255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B107,B74,C12,C21
`Chr6:42630386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B4,B46,C8
`Chr6:42630432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B119,B21,C32,C68,C87,D11
`Chr6:42630493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C37,C53,C60,D11
`Chr6:42630503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B12,B130,B29,B37
`Chr6:42630541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:42630587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769773.1

1181 aa

590

1181

Malectin_like

Malectin

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF12819 Malectin_like 39-400 aa PF11721 Malectin 280-385 aa PF00069 Pkinase 513-778 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 513-779 aa PF00069 Pkinase 906-1101 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 909-1103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769773.1`	Pfam	`PF12819`	Malectin_like	Domain	39	400	9.4e-23	81.7	Malectin-like domain
`XP_057769773.1`	Pfam	`PF11721`	Malectin	Domain	280	385	2.9e-09	37.9	Malectin domain
`XP_057769773.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	513	778	4.5e-69	233.5	Protein kinase domain
`XP_057769773.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	513	779	3.1e-77	260.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057769773.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	906	1101	4.5e-69	233.5	Protein kinase domain
`XP_057769773.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	909	1103	3.1e-77	260.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913790.1
AATCGACAGTTATCTTTATTAAAAAAAAAAAAAGACTAAGAAGTTGACTGCAGATTACAAAATAAAGAATTCAATATCCATCATAGTAATGCAAATCTGATCTATAGCTTGATTACATTCTTCCACAACCCATCTTTAATTTTGAGAACAAAAAAATAAAAAATATGCCAGTTTCAGAATTACCAGTTATTCTCAAATTTCTGTGTTTGTTCTGCGAAATCTTTGTCGTCCTTGCCAGCAGCACTCCTACTACTCATCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989717
ATGCCAGTTTCAGAATTACCAGTTATTCTCAAATTTCTGTGTTTGTTCTGCGAAATCTTTGTCGTCCTTGCCAGCAGCACTCCTACTACTCATCCCCTGCCAGACAGTATTGCCATTTCCTGTGGTTCTTCGGGCAGTTTGATTGCGCTGGATGGACGTGTTTGGATGGGTGATTCGGTACTCGAATCCAGCTTGTCACTGCAGATCAATGGCAAACCTTCCAACTCAAGACCCATCCACCAACTTGCTTCATTCGATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769773.1
MPVSELPVILKFLCLFCEIFVVLASSTPTTHPLPDSIAISCGSSGSLIALDGRVWMGDSVLESSLSLQINGKPSNSRPIHQLASFDSVPCKTARASHHAFSYVFQVKPGQKFIRLHFYQDSYDGFKRSEALFTVKSGPYTLLNNFSTTLAADVLGEKHIIKEYCVNIEDGQPLTITFFPAQGKKKSDDFYAFVNGIEVVSMPTGLYFTPEGELGAHVVGKKYRFYIDNSTALELVQRLNVGGSSILPAQDSCLFRRWDED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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