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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002987`

染色体: Chr06 坐标: 42664861-42668369 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002987`
名称	SmilChr06G002987
描述	uncharacterized SmilChr06G002987
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42664861 - 42668369 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990991`
GeneID	`130990991`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990991`
原始查询	`SmilChr06G002987`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=45.2; qcov=0.75; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990991

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771180.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057771180.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057771180.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771180.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771180.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42665326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:42665608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B40
`Chr6:42665650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B23
`Chr6:42665656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,C59
`Chr6:42666410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr6:42666418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B105,B109,B80,C65
`Chr6:42666465`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B19
`Chr6:42666465`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B19
`Chr6:42666489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B58,C24
`Chr6:42666495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:42666496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,C18,C61
`Chr6:42666497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B80,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771180.1

817 aa

408

817

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF02992 Transposase_21 120-331 aa PF13960 DUF4218 483-578 aa PF13952 DUF4216 681-749 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771180.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	120	331	1.5e-103	345.3	Transposase family tnp2
`XP_057771180.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	483	578	1.4e-41	141.6	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057771180.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	681	749	1.3e-23	84.1	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915197.1
ATGTTGCTAGAAGTGTTAAAAAAGGCATTACCAGATAATGAGTCGCTCCCTAGCTCTTACTATGAGGCTAAGACAATAATTCAAGGGCTTGGATGGAATTATGAGAAGGTCCATGCCTGTGTCAATGATTGTGTGCTATTCAGGAAGAAGTATGAGAACGAAGAAGAGTGCCCAAATTGTTCAGCGCCACGATATAAATTCAATGATTTGGCTAAGGATGCAACTAATGGGAAGCAACGTAAAAAAATCCCTCAAAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990991
ATGTTGCTAGAAGTGTTAAAAAAGGCATTACCAGATAATGAGTCGCTCCCTAGCTCTTACTATGAGGCTAAGACAATAATTCAAGGGCTTGGATGGAATTATGAGAAGGTCCATGCCTGTGTCAATGATTGTGTGCTATTCAGGAAGAAGTATGAGAACGAAGAAGAGTGCCCAAATTGTTCAGCGCCACGATATAAATTCAATGATTTGGCTAAGGATGCAACTAATGGGAAGCAACGTAAAAAAATCCCTCAAAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771180.1
MLLEVLKKALPDNESLPSSYYEAKTIIQGLGWNYEKVHACVNDCVLFRKKYENEEECPNCSAPRYKFNDLAKDATNGKQRKKIPQKILRYFPLKSRLQKLFLFKETAKDMRWHLEQRTDDGVLRHPADAQEWKDFDKKYESFGQEPRNVRLGLASDGFNPFSNMNLSHSTWPVILLPYNLPPWKCLKAPFFILSMLIPGPKSPGNDIDVFQEPLIDELKELWDHGIETYDASTDSLFNLHAAVLWTINDFPAYGNLSGWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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