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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002993`

染色体: Chr06 坐标: 42768444-42772295 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002993`
名称	SmilChr06G002993
描述	laccase-14-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42768444 - 42772295 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989726`
GeneID	`130989726`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989726`
原始查询	`SmilChr06G002993`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	laccase-14-like
产物	laccase-14-like
Arabidopsis	`AT5G09360` (LAC14) laccase 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830795] identity=46.4; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0696900` (OsLAC25) - identity=47.5; qcov=0.977; evalue=1.99e-179; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0046274 (lignin catabolic process); GO:0048046 (apoplast); GO:0052716 (hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989726

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057769783.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769783.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769783.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769783.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769783.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42768774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B17
`Chr6:42768783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B17
`Chr6:42768800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B137,B22,B64
`Chr6:42768890`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B11,B30,B31,B82,B86,C44
`Chr6:42768970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr6:42769038`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	52	A5,B105,B107,B109,B11,B111,B115,B120,B122,B126,B136,B137,B138,B139,B17,B20,B21,B26,B27,B32,B37,B39,B41,B5,B57,B58,B62,B63,B64,B70,B89,B93,B95,B98,C14,C24,C29,C3,C32,C34,C36,C38,C4,C46,C48,C51,C75,C8,C87,D10,D3,D4
`Chr6:42769080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr6:42769091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr6:42769156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B55,C28,C46
`Chr6:42769205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr6:42769314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:42769494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769783.1

571 aa

286

571

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 32-146 aa PF00394 Cu-oxidase 159-304 aa PF07731 Cu-oxidase_2 409-542 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769783.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	32	146	2.7e-40	137.9	Multicopper oxidase
`XP_057769783.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	159	304	6e-39	134.4	Multicopper oxidase
`XP_057769783.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	409	542	4e-45	153.7	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913800.1
TACCTCAACAATACATATCAGAAAAAGAAATAGACAGAAAAAAAAAATGTTTTCGAAGGTTTTCGTCATGTGCTTCTTTGGTATTATTATGGTGGGAGGCATGGCTCCGGTAGTCCATGCTTTAGTTCACAAGTTTGAAGTGAGAAGAACTTCACACAGCAGGCTATGCACCAACAAAACCATGCTAACGGTAAACGGCCAATTCCCGGGGCCAACTATATATGCTAGAAGGGGAGAAGTGGTGGTAGTCGATGTTATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989726
ATGTTTTCGAAGGTTTTCGTCATGTGCTTCTTTGGTATTATTATGGTGGGAGGCATGGCTCCGGTAGTCCATGCTTTAGTTCACAAGTTTGAAGTGAGAAGAACTTCACACAGCAGGCTATGCACCAACAAAACCATGCTAACGGTAAACGGCCAATTCCCGGGGCCAACTATATATGCTAGAAGGGGAGAAGTGGTGGTAGTCGATGTTATTAATCGCTCCCATCAAAATATTACTATCCACTGGCATGGAGTAAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769783.1
MFSKVFVMCFFGIIMVGGMAPVVHALVHKFEVRRTSHSRLCTNKTMLTVNGQFPGPTIYARRGEVVVVDVINRSHQNITIHWHGVKMRRYPWTDGVNYVTQCPISPGKRFRQQIVLSNEEGTLFWHAHSDWSRATVYGAIVILPPKTHTYPFPKPHAQVPILLGEWWNDDVEQVYKNFLAEGRDPKVSDAFVMNGQPGDLYPCSKQDTFKLSVEAGKTYLIRMVNAMMDYIMYFKIHNHNITVVGMDGTYTKPLNTDHVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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