当前解析结果
SmilChr06G003003| 统一新 Gene ID | SmilChr06G003003 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G003003 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G003003 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 42900681 - 42902063 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130989736 |
|---|---|
| GeneID | 130989736 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989736 |
| 原始查询 | SmilChr06G003003 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0008083 (growth factor activity); GO:0010082 (regulation of root meristem growth) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989736 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057769801.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057769801.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057769801.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057769801.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057769801.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:42901203 |
ACG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 53 | A1,A13,A24,A8,A9,B117,B121,B122,B123,B127,B128,B133,B137,B20,B21,B29,B33,B35,B53,B54,B59,B6,B74,B76,B77,B80,B85,B87,B88,B9,B94,B98,C11,C26,C35,C41,C42,C50,C52,C58,C64,C66,C67,C69,C7,C76,C78,C83,C84,C85,C9,D2,D8 |
Chr6:42901208 |
C |
CGT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 43 | A13,A24,A8,B122,B123,B128,B133,B137,B20,B29,B33,B35,B53,B59,B6,B74,B76,B77,B80,B87,B88,B9,B98,C11,C26,C35,C41,C50,C52,C58,C64,C66,C67,C69,C7,C76,C78,C83,C84,C85,C9,D2,D8 |
Chr6:42901731 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C44,C8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。