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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003005`

染色体: Chr06 坐标: 42916904-42921595 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003005`
名称	SmilChr06G003005
描述	O-fucosyltransferase 27
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42916904 - 42921595 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989737`
GeneID	`130989737`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989737`
原始查询	`SmilChr06G003005`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	O-fucosyltransferase 27
产物	O-fucosyltransferase 27
Arabidopsis	`AT3G30300` (AT3G30300) O-fucosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822730] identity=66.5; qcov=0.924; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0132500` - identity=49.2; qcov=0.899; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005768 (endosome); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005802 (trans-Golgi network)
KEGG	-
Pfam	PF10250 (O-FucT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989737

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057769802.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769802.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769802.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769802.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769802.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42917334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:42917380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr6:42917394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:42917516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr6:42917519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr6:42917526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C22,C5
`Chr6:42917591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,D11
`Chr6:42917595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,D7
`Chr6:42917608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:42918435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B136,C13,C36,C78
`Chr6:42918513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B136,C13,C36,C78
`Chr6:42918573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C73,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769802.1

700 aa

350

700

O-FucT

PF10250 O-FucT 118-419 aa

XP_057769803.1

674 aa

337

674

O-FucT

PF10250 O-FucT 92-393 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769802.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	118	419	1.1e-69	236.4	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase
`XP_057769803.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	92	393	9.7e-70	236.6	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913819.1
GTTGGGAAATTGGGAGTAATTGAATTCCGCATTGTAAAAATATTTTCATCAAGAAGGATGACTATCTCCTGGCGTAACCGCACGCGCCGCCGGCGAGAGTGGGGGTGAGCCTAGGAAGTAGTGCATGGGTTTATAAAACGACAAACAAACCTATGTCTGAAGGATTTCGATGTTCCTCAAATCCACCACACAACTCTCTCTCACAAACAACTCCTCCCCGCACCGTCGCAATCGCTCCTCGCACTATTCCTTTTGACTTC...

XM_057913820.1
GTCTGAAGGATTTCGATGTTCCTCAAATCCACCACACAACTCTCTCTCACAAACAACTCCTCCCCGCACCGTCGCAATCGCTCCTCGCACTATTCCTTTTGACTTCATTTTTTTCTCACGCGCTCTCACTGCTCTTGCGCGTGACAAACCTCTAGCATGAAGTGGGTCTCCCCCACCAAACTCGGCGGCGCCGGCGCCGGCGGGGAGGCCAAGGCGGTGCTCTTCAAGTCCAAGTTGAAATGGGTCGGACTGTTTGGTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989737
ATGAAGTGGGTCTCCCCCACCAAACTCGGCGGCGCCGGCGCCGGCGGGGAGGCCAAGGCGGTGCTCTTCAAGTCCAAGTTGAAATGGGTCGGACTGTTTGGTCTTGTCCTCTCCGCTTTCTCTCTCTTCACGCACTTCCTTCTCGCCAGATACAGTGTTGGGGTTGCTGTTTCCGAGTACAAATCTTCAATCACAATCTTTTCTTGGAGGCCCATTTTCGAGAATGCCAATTCTCCCCCCGCTCCTAAATTGTACAGAAG...

LOC130989737
ATGGGTCGGACTGTTTGGTCTTGTCCTCTCCGCTTTCTCTCTCTTCACGCACTTCCTTCTCGCCAGATACAGTGTTGGGGTTGCTGTTTCCGAGTACAAATCTTCAATCACAATCTTTTCTTGGAGGCCCATTTTCGAGAATGCCAATTCTCCCCCCGCTGTAATCCTAAATTGTACAGAAGACTTTGGGCCCCTGTGAAGCATCTTGAATCTGTAAATCCCTATGCAAATCCCAGAGCAAACTATGTAGCTCCTCCTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769802.1
MKWVSPTKLGGAGAGGEAKAVLFKSKLKWVGLFGLVLSAFSLFTHFLLARYSVGVAVSEYKSSITIFSWRPIFENANSPPAPKLYRRLWAPVKHLESVNPYANPRANYVAPPPQTDRFIFVRIRGGFHEIRNSICDVVVVARLLNATLVIPEIQSTTSSKGISTEFKSFAYLYSEDQFMTALVGDIRIVKTLPKDLKGARRKKEIPSFKASSSASPYFYLHHVLPVLNKHAVVELVVPDGGCLQALLPQQLEEYQRLRCR...

XP_057769803.1
MGRTVWSCPLRFLSLHALPSRQIQCWGCCFRVQIFNHNLFLEAHFRECQFSPRCNPKLYRRLWAPVKHLESVNPYANPRANYVAPPPQTDRFIFVRIRGGFHEIRNSICDVVVVARLLNATLVIPEIQSTTSSKGISTEFKSFAYLYSEDQFMTALVGDIRIVKTLPKDLKGARRKKEIPSFKASSSASPYFYLHHVLPVLNKHAVVELVVPDGGCLQALLPQQLEEYQRLRCRVAFHAIKFREEVQELASKILYRLRSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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