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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003006`

染色体: Chr06 坐标: 42931235-42934055 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003006`
名称	SmilChr06G003006
描述	uncharacterized SmilChr06G003006
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42931235 - 42934055 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989739`
GeneID	`130989739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989739`
原始查询	`SmilChr06G003006`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clast3-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821426]; symbol=AT3G18940; hit=AT3G18940; species=arabidopsis; confidence=high
产物	clast3-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821426]; symbol=AT3G18940; hit=AT3G18940; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G18940` (AT3G18940) clast3-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821426] identity=62.8; qcov=1.02; evalue=7.47e-127; confidence=high
Rice	`Os03g0766900` (OSJNBa0079B15.8) - identity=57.3; qcov=1; evalue=1.45e-113; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0043248 (proteasome assembly)
KEGG	-
Pfam	PF09754 (PAC2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769804.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769804.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057769804.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769804.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769804.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42931434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:42931858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr6:42931861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:42932823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr6:42932825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,D7
`Chr6:42932835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr6:42933321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:42933404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B24,B33,C20,C27
`Chr6:42933798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B80,D10
`Chr6:42933801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr6:42933826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769804.1

280 aa

140

280

PAC2

PF09754 PAC2 18-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769804.1`	Pfam	`PF09754`	PAC2	Family	18	248	3.5e-22	80.0	PAC2 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913821.1
GAGCCTATGTATAAAATCACTGGTTTTTTTTTTTTTTGAAGCATATAAAATCACTGTTTAGAAATAGTAGAGAAACTGTCCCAATGTTTAATTTCTGAATAACCGAAAATTGCAGCGCCAAAACGACAGCAGAATTGCATTAATGGAGTTTTATCTTGAAGATGGAAAACAATTATCCCCTAACTCATCCACTCTAATTCTGCCGGCTCTCTCGATCGGAAATGTAGGACAGTTAGCTGTAGATCTGTTAATTTCGTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989739
ATGGAGTTTTATCTTGAAGATGGAAAACAATTATCCCCTAACTCATCCACTCTAATTCTGCCGGCTCTCTCGATCGGAAATGTAGGACAGTTAGCTGTAGATCTGTTAATTTCGTCTCTAGAAGCAGAAAAAATCGGCTGTTTAGATGATCAGAATGTGCTTCCTTGTGTTGGCAATGATGCTTATTCGCCGGCGCCTCTCGGAAAACTAGCTCTTTCTCTCGAAGCTTATGAATCATCTTCCAGTGCATTGACACTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769804.1
MEFYLEDGKQLSPNSSTLILPALSIGNVGQLAVDLLISSLEAEKIGCLDDQNVLPCVGNDAYSPAPLGKLALSLEAYESSSSALTLVQQRSPVIKGMMVAYAKNIANFAAANGKKHVVLLSSLDFGRWRNIDMSSGLQIYYLSSSNLDGTDAACESLGWKRLQDYDPALRTWKYLDTLAQEVPIPEEDSPFEELGDEDYYPSLPFAALFSCFKAKGLKVTCLFCYCSEGDNIPEAFSMAEAASKLVGLNDFLGDGNGAGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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