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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003015`

染色体: Chr06 坐标: 43004066-43006611 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003015`
名称	SmilChr06G003015
描述	uncharacterized SmilChr06G003015
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43004066 - 43006611 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989748`
GeneID	`130989748`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989748`
原始查询	`SmilChr06G003015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833882]; symbol=AT5G38900; hit=AT5G38900; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833882]; symbol=AT5G38900; hit=AT5G38900; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G38900` (AT5G38900) Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833882] identity=62.9; qcov=0.987; evalue=1.97e-107; confidence=high
Rice	`Os03g0598900` - identity=62.8; qcov=0.94; evalue=1.48e-99; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01323 (DSBA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989748

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057769817.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.40000	`XP_057769817.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769817.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769817.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769817.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43004486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C23,C40
`Chr6:43004743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,D11
`Chr6:43005261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C5
`Chr6:43005273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:43005471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr6:43005658`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A11,A3,B117,B121,B34,B45,B5,B57,B74,B79,B82,B97,C34,C60,C83,D1
`Chr6:43005685`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A1,A11,A3,B113,B117,B121,B18,B3,B34,B45,B5,B57,B58,B74,B79,B82,B93,B97,C34,C47,C55,C60,C67,C77,C78,C83,D1
`Chr6:43005821`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C47
`Chr6:43005821`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C47
`Chr6:43005864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr6:43005891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:43006291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769817.1

232 aa

116

232

DSBA

PF01323 DSBA 31-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769817.1`	Pfam	`PF01323`	DSBA	Domain	31	228	9.6e-33	114.3	DSBA-like thioredoxin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913834.1
TTACAAAACTCGCTATTTCCATAAAGTCATTCACAAGTTGTATGAATCGAAGACCGGGAGAAGCGTTCGGAGCTGGGACGGCCGGAACCTCATCGGTGTTTGAATCGAAGGAAGAGTCGGAAGAAGACAAAACAGAGCATGGTTGCATTGACTTTATTACCCTCAACTACTAGCGGGTCGTTAGGAGATTCCTTTCAGAAACACAAACGGAATATTTATCTATATTTTTTGCGCGGAGAGTTTTCATTTAGTCAAACGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989748
ATGCTTCGCCACTGTTCCAATAATTCTCAGCTTCTTCGGATTTCCAGATCAATCTCGATGAGTAGCAGCAGTGTAAAGAAACTCATTAAGATCGATGTCGTTGCCGACACCGTCTGCCCATGGTGCTTCGTGGGCAAAAAGAATTTGGACAAAGCAATAGCTTCATCAAATGATCAATACAATTTCGAGATCAAATGGCATCCTTATATGCTTAATCCAAATGCGCCAAAAGAAGGCGTTGTTAAGAAGGATTATTACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769817.1
MLRHCSNNSQLLRISRSISMSSSSVKKLIKIDVVADTVCPWCFVGKKNLDKAIASSNDQYNFEIKWHPYMLNPNAPKEGVVKKDYYLNRFGPRSIQMESRMAEIFKGLGMDNYDTSGLTGNTLDSHRLIYFAGTQGLDKQHKLVEELGVGYFTQGKYIGDKEFLVECAKKVGVEGAAEFLQDPNNGLKEVNEDLKRYASQINGVPHYTINGKNQLSGGQPPETFLRAFQTAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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