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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003036`

染色体: Chr06 坐标: 43210346-43216060 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003036`
名称	SmilChr06G003036
描述	PI-PLC X domain-containing protein At5g67130-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43210346 - 43216060 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989768`
GeneID	`130989768`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989768`
原始查询	`SmilChr06G003036`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PI-PLC X domain-containing protein At5g67130-like
产物	PI-PLC X domain-containing protein At5g67130-like
Arabidopsis	`AT1G13680` (AT1G13680) PLC-like phosphodiesterases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837929] identity=63.4; qcov=0.986; evalue=4.13e-163; confidence=high
Rice	`Os03g0415200` (OSJNBb0059G13.6) - identity=71; qcov=0.919; evalue=6.57e-176; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008081 (phosphoric diester hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF26146 (PI-PLC_X)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989768

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057769850.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057769849.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057769850.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057769849.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769849.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43211626`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A19,A22,B12,B130,B140,B36,B46,B69,B72,B8,B98,C13,C16,C24,C25,C79,C85,C86
`Chr6:43211630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B55,C23,C54
`Chr6:43211897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr6:43211903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B96,C8
`Chr6:43211915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C17
`Chr6:43211991`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr6:43211991`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr6:43212003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr6:43213211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B100,B97,C83
`Chr6:43213249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B40,C24,C34,D2
`Chr6:43213256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:43213538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769849.1

364 aa

182

364

PI-PLC_X

PF26146 PI-PLC_X 78-321 aa

XP_057769850.1

357 aa

178

357

PI-PLC_X

PF26146 PI-PLC_X 77-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769849.1`	Pfam	`PF26146`	PI-PLC_X	Domain	78	321	5.6e-25	89.0	PI-PLC X 1
`XP_057769850.1`	Pfam	`PF26146`	PI-PLC_X	Domain	77	321	5.3e-25	89.1	PI-PLC X 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090743.1
CTTTCATGGAAAACGAAATTACGTCTTTTATTGCTCAAACGTAACATATAAAACACATCATTTCCTTTGGTTACTCAGACAAATTAAATTAATTCTTGAATTTTTATATATTTGAAGCTGAGTTTCATTGGGTGCCAACAAAGAATTATTTTGGATGGCGATGTGGAGAGTCCTTGTTGTGGCAATAACAACAGCGTTGCTTCTGTTCAAGCTCGGCTCCGCCTGCTCTAATGGAGCTTGCAAGGTGGGGGATAATTGTT...

XM_057913867.1
GTGCTGACCTTTGGCATGTCTTTCATGGAAAACGAAATTACGTCTTTTATTGCTCAAACGTAACATATAAAACACATCATTTCCTTTGGTTACTCAGACAAATTAAATTAATTCTTGAATTTTTATATATTTGAAGCTGAGTTTCATTGGGTGCCAACAAAGAATTATTTTGGATGGCGATGTGGAGAGTCCTTGTTGTGGCAATAACAACAGCGTTGCTTCTGTTCAAGCTCGGCTCCGCCTGCTCTAATGGAGCTTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989768
ATGGCGATGTGGAGAGTCCTTGTTGTGGCAATAACAACAGCGTTGCTTCTGTTCAAGCTCGGCTCCGCCTGCTCTAATGGAGCTTGCAAGGTGGGGGATAATTGTTCATCCGATTCAGATTGCGGGCCGGGCCTGTATTGCTTTTCTTGTGAAGCAGGCTTTGATGGCTCCAAATGTGTGAGAACAGCAGCCACCAATCAGTTCACCCTACTCAATAATTCCTTGGCATTCAACAAGTACGCCTTCTTGACAACCCACAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769849.1
MAMWRVLVVAITTALLLFKLGSACSNGACKVGDNCSSDSDCGPGLYCFSCEAGFDGSKCVRTAATNQFTLLNNSLAFNKYAFLTTHNSFAIDDGKPRLTFTNQEDNVTQQLTNGVRALMLDTYDFEGDIWLCHSFGGQCHDYTKFEPAIDTLREIEAFMSENPSEIVTLILEDYVQTPKGLTKVFTDAGLMKYWFPLSKMPQNGQDWPLVADMISNNQRLLVFTSQKSKEADEGIAYQWNYMVENQYGDDGMKEECSNRG...

XP_057769850.1
MAMWRVLVVAITTALLLFKLGSACSNGACKVGDNCSSDSDCGPGLYCFSCEAGFDGSKCVRTAATNQFTLLNNSLAFNKYAFLTTHNSFAIDDGKPRLTFTNQEDNVTQQLTNGVRALMLDTYDFEGDIWLCHSFGGQCHDYTKFEPAIDTLREIEAFMSENPSEIVTLILEDYVQTPKGLTKVFTDAGLMKYWFPLSKMPQNGQDWPLVADMISNNQRLLVFTSQKSKEADEGIAYQWNYMVENQYGDDGMKEECSNRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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