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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003050`

染色体: Chr06 坐标: 43399304-43402141 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003050`
名称	SmilChr06G003050
描述	uncharacterized SmilChr06G003050
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43399304 - 43402141 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989781`
GeneID	`130989781`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989781`
原始查询	`SmilChr06G003050`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0190600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os07g0190600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G52950` (AT1G52950) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841728] identity=25; qcov=1.03; evalue=2.47e-23; confidence=low
Rice	`Os07g0190600` - identity=27.4; qcov=1.02; evalue=4.71e-28; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02721 (DUF223); PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989781

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769866.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057769866.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769866.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769866.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769866.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43399620`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B108,B122,B135,B75,B99,C35
`Chr6:43399709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B103,B105,B2,B48,B60,B66,B90,B92,C2,C25,C36,D5
`Chr6:43399710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A21,A9,B14,B140,B20,B58,B61,B89,C6,C62,C68,C77,C78,C8,C83
`Chr6:43399732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B136,B72,B99,C46
`Chr6:43399732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B72,B99,C46
`Chr6:43399841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B121,B97,C51,C69
`Chr6:43399908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:43400067`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A19,B10,B101,B128,B134,B16,B17,B38,B56,B60,B71,B75,B78,B79,B8,B96,C11,C21,C24,C29,C40,C41,C45,C52,C57,C69,C86
`Chr6:43400070`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A19,B10,B101,B128,B134,B16,B17,B38,B56,B60,B71,B75,B78,B79,B8,B96,C11,C21,C24,C29,C40,C41,C45,C52,C57,C69,C86
`Chr6:43400241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B13,C54,C59,C76
`Chr6:43400248`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	30	A16,A3,A9,B111,B115,B127,B13,B16,B25,B30,B35,B37,B53,B60,B66,B69,B77,C15,C16,C30,C36,C4,C41,C60,C61,C64,C66,C70,C84,D11
`Chr6:43400261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	70	A1,A13,A14,A16,A3,A4,A8,B10,B100,B11,B110,B117,B12,B121,B123,B125,B129,B131,B135,B137,B138,B18,B21,B28,B34,B37,B4,B41,B51,B52,B53,B54,B6,B64,B66,B68,B7,B73,B76,B83,B84,B87,C12,C16,C19,C21,C24,C27,C3,C32,C36,C4,C43,C45,C50,C52,C55,C64,C66,C67,C68,C7,C70,C72,C73,C76,C84,D3,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769866.1

361 aa

180

361

DUF223

Rep_fac-A_C

PF02721 DUF223 11-128 aa PF08646 Rep_fac-A_C 297-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769866.1`	Pfam	`PF02721`	DUF223	Domain	11	128	1.6e-18	67.7	Domain of unknown function DUF223
`XP_057769866.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	297	356	2.8e-08	34.4	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913883.1
TAAACATTATATACAAAAGCTTAACAATTTTGCAAAAAGCTGTCAAATTACATACAACAAATCTCTCCTCACCGTCCAGGAAATCAGCAAACATCACAAATCCTGCAACCACAAAAGATTTCAAAAATTTTTTAGCTTCATATTTGGATTCATGCCCAGTATGTGGTCTTCCATTTGTGATTTGGATGACTCAAGAACCACATTTGGCGTCAAAGTTCGACTGGTCCGCTCCTATGGAAATCCTTCATTTACAAACAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989781
ATGCCCAGTATGTGGTCTTCCATTTGTGATTTGGATGACTCAAGAACCACATTTGGCGTCAAAGTTCGACTGGTCCGCTCCTATGGAAATCCTTCATTTACAAACAAAGAAGAAATCGTTAGTTGGGAATGCATTCTTCATGATTTTCAAGGAGATAGAATTGAGGCTACCATTCCCAAGAATCTCATTGCCACCTTCAAAGATCAATTGGTGGAAGGATTGGTGTATGGAATAAAAAATTTCAAGGTCGTGCACAACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769866.1
MPSMWSSICDLDDSRTTFGVKVRLVRSYGNPSFTNKEEIVSWECILHDFQGDRIEATIPKNLIATFKDQLVEGLVYGIKNFKVVHNTKKNKLTTHKYKIILCEDTKIHELFVQNFPMKRFSFKSFEEVQVKDNLYNGSLFDIIGVLVHPGEVQIRTSSTGEQKKLIELTLEDTERRRLYCTLWENYVDDFLKLFEKENQDTNILIVQFCKTSIYRGEIRACNAFNVTNLLLNADVPEINDFRERLVKESSLNTTNNSSIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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