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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003069`

染色体: Chr06 坐标: 43577400-43578756 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003069`
名称	SmilChr06G003069
描述	uncharacterized SmilChr06G003069
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43577400 - 43578756 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989795`
GeneID	`130989795`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989795`
原始查询	`SmilChr06G003069`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0256300` - identity=43.1; qcov=0.422; evalue=6.98e-13; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989795

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057769876.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057769876.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769876.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769876.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769876.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43578152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B51,B62
`Chr6:43578170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr6:43578180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,C1,C40
`Chr6:43578193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr6:43578200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C17
`Chr6:43578204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B40,C6
`Chr6:43578235`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	82	A10,A15,A16,A19,A2,A21,A24,A25,A4,A5,B104,B105,B107,B11,B110,B112,B119,B12,B127,B129,B132,B134,B138,B17,B20,B23,B24,B28,B31,B33,B40,B42,B43,B49,B53,B55,B62,B64,B66,B68,B76,B78,B80,B89,B9,B91,B93,B97,C11,C12,C14,C21,C22,C23,C28,C3,C32,C33,C37,C40,C42,C45,C46,C50,C52,C57,C58,C62,C68,C69,C71,C72,C73,C74,C79,C8,C80,D1,D11,D3,D4,D9
`Chr6:43578250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C17
`Chr6:43578270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C53
`Chr6:43578284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B135,B35,C61,C62
`Chr6:43578284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B35,C61,C62
`Chr6:43578330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	49	A1,A13,A9,B100,B121,B122,B123,B126,B128,B133,B137,B18,B2,B30,B31,B37,B47,B54,B6,B62,B69,B70,B71,B72,B81,B83,B85,B87,B88,C1,C21,C26,C3,C35,C36,C39,C50,C57,C58,C63,C64,C66,C67,C76,C79,C83,C85,C9,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769876.1

154 aa

154

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 40-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769876.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	40	74	7.6e-08	33.1	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913893.1
TCTCTCTCTATATCCTCACACTCATCATCGGCTCCCTCTCTTCCCCTCTCTATCCGCCGCCCTCTCTTTCTCCCACATGAAGCCACGCCATCGCCCCTCTTCCCGGCGAGTCATCGCCGGGAACCACCTCTGGCCGTAAGCCATGTTTCTCTCCTTCTCCCATCTGTCCCTCACTCTCCCTCGCGTACATCGGACGGCAGACGATCATAGAAGGCCGTCGTCGTTGCTGCTCTGCTCTCGGCCACGACCAGCGGCGCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989795
ATGAGTTTCAATTCAGCTTTCGGTTCTGGCTCGAGCTCGTGGCGCGGTCGCCGGCAGGGTGATAGTGCAGAGAATCCTGTGTTTTGCATTTGCGAAGTTGAAGGTAAAAAATTGAAGGCTTCGATTATGACATCGTGGACGGAAGATAATCCGGGTAGGAGATTCTATGGATGTAGGAATTGGAAGGCTAGGCACTGCGGTTTTTTTGATTGGATTGACGCCCCCATAACTGAAAGAGCTAAGGAGGTTATCAACGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769876.1
MSFNSAFGSGSSSWRGRRQGDSAENPVFCICEVEGKKLKASIMTSWTEDNPGRRFYGCRNWKARHCGFFDWIDAPITERAKEVINDLKSENLKLMKVKHESSKTETMDVELEIERLWGAMQTMKEDSKKMMKKTSLVSFLFVASWVAIAYYAIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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