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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003077`

染色体: Chr06 坐标: 43668952-43670735 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003077`
名称	SmilChr06G003077
描述	uncharacterized SmilChr06G003077
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43668952 - 43670735 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989804`
GeneID	`130989804`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989804`
原始查询	`SmilChr06G003077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF1262 family protein (DUF1262) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842456]; symbol=AT1G61600; hit=AT1G61600; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DUF1262 family protein (DUF1262) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842456]; symbol=AT1G61600; hit=AT1G61600; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G61600` (AT1G61600) DUF1262 family protein (DUF1262) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842456] identity=41.9; qcov=1.08; evalue=8.33e-89; confidence=medium
Rice	`Os08g0413100` (OSJNBa0007M04.25) - identity=39.6; qcov=1.07; evalue=2.51e-79; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06880 (DUF1262)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989804

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057769885.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769885.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057769885.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769885.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769885.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43669508`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B73
`Chr6:43669508`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B73
`Chr6:43669868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B67,C63
`Chr6:43669939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr6:43670036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr6:43670139`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B26
`Chr6:43670139`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B26
`Chr6:43670200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,C45
`Chr6:43670431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769885.1

392 aa

196

392

DUF1262

PF06880 DUF1262 25-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769885.1`	Pfam	`PF06880`	DUF1262	Family	25	123	2.2e-34	118.5	Protein of unknown function (DUF1262)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913902.1
ACCTTTTGATTAGGCCATGATATTTCTGAAGCAATGTTATGTAATTAACTTTTCTGTATGTGTATGAATTATTCAATTGTTTATCAAGTTTTTGGTAGAGGGCATGCCCTTTTCTACACTCATATTAATCTTCAACTATGCTTTAAAAAAGATAGTGATCTCTCTTTTTGAATAATGCAAAAAGGAAAAGTTGAGAGATAAGATCTAAAGTGAAAGAGGGCCAAAAGCAGTTTCTTTAATTTCCCAATAACAAGTGATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989804
ATGTACGTCAGCAGACCGCGTTCAATCTACCACCACTTCCCCGGAGCTCTCTCGTTGCAGCCGCAGGTAGATGTTCCGTATTCAGGCCACCTCGTTGTGACAGATGAAGATTCGGAGGCGATGGATTCCTTCTGCTGTGGAATATGGAGGAATCACAGAATCAGTAGGCTGCCATTCCCTTCAGACAGAATCTTGCAGGTGGTGCACTCTTCGTTGCAGGAGGAGGCCGGCGTGATCAAGGCGTGGTTCATACCTGTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769885.1
MYVSRPRSIYHHFPGALSLQPQVDVPYSGHLVVTDEDSEAMDSFCCGIWRNHRISRLPFPSDRILQVVHSSLQEEAGVIKAWFIPVLDQPLSSNRYYVIKAKGRRKGQAYTCSREGEVGVCCFRRPRVESKTRPFDHRDRYQQLEIRPFHGGGFFARSVEWDGYPPSFLRRGGWEVYTVASCRLRLHEAPGLLETIPLGFPDRDLPLHSRRSTPVVMGRWYCPCVMVKDGDVGAHDQMRKCMVYELSLKQWWEQIHSVEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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