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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003084`

染色体: Chr06 坐标: 43711869-43720328 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003084`
名称	SmilChr06G003084
描述	protein trichome birefringence-like 19
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43711869 - 43720328 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989811`
GeneID	`130989811`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989811`
原始查询	`SmilChr06G003084`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 19
产物	protein trichome birefringence-like 19
Arabidopsis	`AT5G15900` (TBL19) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 19 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831447] identity=50.7; qcov=1.01; evalue=7.47e-144; confidence=high
Rice	`Os01g0652800` (OsTBL57) - identity=49.5; qcov=0.963; evalue=7.26e-133; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989811

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057769898.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769898.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769898.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769898.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769898.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43719378`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B134,B56,C72
`Chr6:43719378`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B134,B56,C72
`Chr6:43719390`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B134,B56,C72
`Chr6:43719390`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B134,B56,C72
`Chr6:43719413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B85,B94,C14,D7
`Chr6:43719585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr6:43719626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:43719659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr6:43719698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B14,B82,D10
`Chr6:43719779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr6:43719791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B46
`Chr6:43719791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769898.1

401 aa

200

401

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 55-107 aa PF13839 PC-Esterase 108-392 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769898.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	55	107	1.9e-21	76.8	PMR5 N terminal Domain
`XP_057769898.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	108	392	2e-81	274.8	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913915.1
GCGTACTATTTTTCACAAAAACAAACAATACACTGTCATCTCATCACCGACGAGAAATATTATTAACAGCTATATCAATTTATATTTTTATTTAGTATAAATACCTTTTTGTGTTGCACTATAAAGACACTTACTCACATACACAAAACCTCCATAGAAATGAGCTAAGTTTTGCTGTATGAGTTACACACACCATTCCCGTGCATATGATGAAATCCCAAATGCGAAAGAAATCACGAAAGCTAGCTCCAATCGCAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989811
ATGATGAAATCCCAAATGCGAAAGAAATCACGAAAGCTAGCTCCAATCGCAGCCCTAACACTCCTCCTATCAATCTCTCTATACCTCTCCTTCATCGGCGATTCCTCCCACCACAAACTACCCCAAACTCTCCCTTCACACCACGATCCGCCCCAATTCGACCAATGCGACCTGTTTTCCGGCGAATGGGTGCCGAATCCGGACGCCCCCTGCTACACCAATGAGACCTGCTATGCGATTCAGGAACACCAGAATTGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769898.1
MMKSQMRKKSRKLAPIAALTLLLSISLYLSFIGDSSHHKLPQTLPSHHDPPQFDQCDLFSGEWVPNPDAPCYTNETCYAIQEHQNCLKFGRPDTGYLKWRWKPDACDLPLFQPDRFLQLMRGKSLAFVGDSVSRNHMQSLICLLSKVALPKEFSESGKQIWHRYREHDFNISIFWTPFLVKTGILDPSLNRPFDIYLDEFDDTWSDQIANFDYVILSAGHWFFRPSYLYLNRRLHGCVYCPEPDSNITHLAPSFAFRRAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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