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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003088`

染色体: Chr06 坐标: 43736642-43738595 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003088`
名称	SmilChr06G003088
描述	uncharacterized SmilChr06G003088
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43736642 - 43738595 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989814`
GeneID	`130989814`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989814`
原始查询	`SmilChr06G003088`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989814

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769902.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769902.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769902.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769902.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769902.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43736908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B33,C46
`Chr6:43736918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B83
`Chr6:43736924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B28,C28,C73
`Chr6:43736930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A5,A8,B109,B113,B40,B55,B59,C35,C9,D8
`Chr6:43736995`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B111
`Chr6:43736995`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B111
`Chr6:43736996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B135,B16,C81,D11
`Chr6:43737017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	56	A15,A2,A4,A7,A8,B103,B106,B109,B112,B118,B121,B125,B129,B130,B138,B14,B2,B21,B22,B24,B29,B3,B31,B4,B40,B41,B47,B51,B53,B61,B64,B66,B72,B77,B88,B89,B9,B99,C11,C15,C32,C34,C38,C41,C43,C44,C46,C48,C60,C65,C68,C69,C75,C87,D1,D3
`Chr6:43737069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A9,B15,B85,C38
`Chr6:43737078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr6:43737088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr6:43737093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,C22,C5,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769902.1

233 aa

116

233

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 172-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769902.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	172	233	2.7e-11	44.5	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090762.1
TCCAACAAACCCTGACATAGATGATGACACCACAATAGTGCATCCTCGTGGTGGTTTGATAGATATTGATGATGCCGATGAGGAAGACGAAGAAGACACATATTTGACTGATGAAGAAGATAGAAACTTGGATGATAGTTTTTAGTGTCAGATGGCTAGAGGAAGCAGTGACACGCACAGTGGTAGACGAGGGCGCGGTGATGGTAGAGGGCGATCATCATCCTCTGGGGCATCATCACAGGCGTCTGATGAGGGCATTC...

XM_057913919.1
TCCAACAAACCCTGACATAGATGATGACACCACAATAGTGCATCCTCGTGGTGGTTTGATAGATATTGATGATGCCGATGAGGAAGACGAAGAAGACACATATTTGACTGATGAAGAAGATAGAAACTTGGATGATAGTTTTTAGTGTCAGATGGCTAGAGGAAGCAGTGACACGCACAGTGGTAGACGAGGGCGCGGTGATGGTAGAGGGCGATCATCATCCTCTGGGGCATCATCACAGGCGTCTGATGAGGGCATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989814
ATGGCTAGAGGAAGCAGTGACACGCACAGTGGTAGACGAGGGCGCGGTGATGGTAGAGGGCGATCATCATCCTCTGGGGCATCATCACAGGCGTCTGATGAGGGCATTCATGATTCAGTTGCCCAGATACAGTTGGCTGGAGGTAGTGGATCCGCTCCGACATCATCAGAAGATACCGTGCCCAGCAGCCACTCGAGCACAGGGCGGATTATGTTGACCATTACACCTCAGGGTAAGATCTACCCATACGAGTACGTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769902.1
MARGSSDTHSGRRGRGDGRGRSSSSGASSQASDEGIHDSVAQIQLAGGSGSAPTSSEDTVPSSHSSTGRIMLTITPQGKIYPYEYVPKACTHIFKQVRNPNGFNWKATHDDVKNLYFMEFKKHFMWDDSIEQAVKLDFMKIAARRYKDFVYEIKMANDDPKKGRPPFIHEREWPDWLSYWRSEAVVKKSETAKKCRMSEPEGPGTGQVKHKGGSKSTLQIADEIAKKKGVDPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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