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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003090`

染色体: Chr06 坐标: 43751636-43753957 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003090`
名称	SmilChr06G003090
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43751636 - 43753957 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989816`
GeneID	`130989816`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989816`
原始查询	`SmilChr06G003090`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase-like
Arabidopsis	`AT4G26830` (AT4G26830) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828790] identity=40.4; qcov=1; evalue=5.34e-116; confidence=medium
Rice	`Os01g0739700` - identity=40.6; qcov=0.951; evalue=5.96e-115; confidence=medium
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989816

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057769905.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057769905.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057769905.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769905.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769905.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43751800`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B40,B46,C46,C5,C87
`Chr6:43751800`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B40,B46,C46,C5,C87
`Chr6:43751820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr6:43751822`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B8,C22,C45
`Chr6:43751822`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B8,C22,C45
`Chr6:43751828`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	84	A10,A13,A16,A22,A23,B10,B101,B105,B107,B117,B119,B12,B120,B121,B123,B124,B13,B130,B135,B15,B16,B17,B18,B29,B32,B33,B34,B37,B42,B43,B45,B49,B5,B50,B53,B55,B56,B61,B63,B64,B66,B67,B80,B82,B86,B90,B91,B92,B95,B96,B97,B98,B99,C16,C21,C23,C24,C28,C30,C31,C33,C35,C36,C37,C4,C40,C47,C48,C5,C52,C53,C6,C60,C61,C64,C66,C7,C73,C78,C81,C83,C84,D10,D2
`Chr6:43751830`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	82	A10,A13,A16,A22,A23,B10,B101,B105,B107,B117,B119,B12,B120,B121,B123,B124,B13,B130,B135,B15,B16,B17,B18,B29,B32,B33,B37,B42,B43,B45,B49,B5,B50,B53,B55,B56,B61,B63,B64,B66,B67,B80,B82,B86,B90,B91,B92,B95,B96,B97,B98,B99,C16,C21,C23,C24,C28,C30,C31,C33,C35,C36,C37,C4,C40,C47,C48,C5,C52,C53,C6,C60,C61,C64,C66,C7,C73,C78,C81,C83,D10,D2
`Chr6:43751850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:43751852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:43751876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B37,B44,B69,C38
`Chr6:43751906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:43752005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B37,B44,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769905.1

450 aa

225

450

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 24-341 aa PF07983 X8 363-433 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769905.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	24	341	9.5e-79	265.9	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057769905.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	363	433	2.7e-20	73.5	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913922.1
ATCGCACTAATTAAATTTATTTCCCCCCTTTCTAGCCAGATAATATTAAACTTGGTTTACTTCAATTTTTATCTCTCTCAACTCCAAAGTATAAAGATGTTATATATATAGTGAGTTACTGAGTCCACTACAAACAAAACTTAAAACAATGTATGATTTGGTCCTCCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACTTCACCTCACCGCCGCGAGTCTCCGGCGTTGGCGTAAACTACGGCACACTGGGAAACAACCTCCCGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989816
ATGTATGATTTGGTCCTCCCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACTTCACCTCACCGCCGCGAGTCTCCGGCGTTGGCGTAAACTACGGCACACTGGGAAACAACCTCCCGCCGCCGAAGAAGGTGGCGCAGCTGCTCCAGTCCACCCTCATTTCCAAGGTCAAGATCTACGACACCAACCCCGACATCCTGGCCGCCTTCTCCAACACCGGCATCGACCTCATCGTCGCCGTCGAGAACTCCCATGTCGCCAACCTCAGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769905.1
MYDLVLPLLLLLLHFTSPPRVSGVGVNYGTLGNNLPPPKKVAQLLQSTLISKVKIYDTNPDILAAFSNTGIDLIVAVENSHVANLSSNPSAAADWFTSRVAPFIPATSVVAVAVGNEYFTAEPDLDPNALPKAMKNLHAALVSRGLDRKIKVTTPHSMAVLAASFPPSAATFAATLVPAMTAVVGFLADTGAPFMVNAYPYFAYRDNPKIIDLEYALLGNATGGGVADNGLTYTNMLDAQIDAVRSAVGSLGFANRSVRM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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